Новости Генетики расшифровали скрытый код вчеловеческой ДНК
http://news.mail.ru/society/3768972/
МОСКВА, 5 мая - РИА Новости. Британские и канадские ученые составили словарь
<тайнописи>, скрытой в коде ДНК, которая позволяет с помощью одного и того
же гена получать <инструкции> для синтеза в клетках разных белков, говорится
в статье, которая будет опубликована в завтрашнем номере журнала Nature.
У сложных организмов последовательности элементов ДНК - нуклеотидов,
содержащие информацию для синтеза тех или иных белков (эксоны), чередуются с
<пустыми> участками (интронами). В процессе синтеза белка пустые участки
удаляются, а информативные <склеиваются>, однако это удаление и склейка
может происходить разными способами. Разным получается и результат синтеза -
белок.
Этот процесс - альтернативный сплайсинг - дает различным клеткам возможность
по-разному <прочитать> один и тот же ген, что позволяет существенно
увеличить информационную емкость генома.
Изучение механизма сплайсинга и, в частности, прогнозирование его
результатов в разных тканях организма оказалось достаточно трудной задачей.
Исследование под руководством профессоров Брендана Фрея (Brendan Frey) и
Бенджамина Бленкоу (Benjamin Blencowe) из университета Торонто, по словам
его авторов, представляет собой описание <кода сплайсинга>, <словаря>
комбинаций из сотен характеристик РНК и результатов сплайсинга для большого
количества эксонов.
<Человеческая ДНК содержит 22 тысячи генов. Может показаться, что это много,
но только если не учесть, что у тополя их 45 тысяч. Мы хотели понять, как
информация, нужная для того, чтобы создать нечто такое сложное, как
человеческий мозг, может быть закодирована в относительно небольшом
количестве генов. Мы открыли скрытый код внутри ДНК, который клетки живых
организмов используют, чтобы получить из 20 тысяч генов сотни тысяч
генетических сообщений, переставляя их части>, - сказал Фрей, которого
цитирует пресс-служба университета.
Исследователи собрали информацию о включении или удалении более трех тысяч
эксонов м-РНК в четырех типах ткани у мышей, а также данные о других
характеристиках этих РНК. Затем с помощью компьютерной модели они
определили, какие комбинации характеристик лучше всего объясняют
специфические для конкретного типа ткани результаты альтернативного
сплайсинга.
По мнению разработчиков модели, с учетом сложности задачи им удалось
получить достаточно точные результаты. В частности, система успешно
предсказывала изменения в комбинациях эксонов для конкретных пар тканей.
Кроме того, полученный код предполагает, что включение эксонов, которые
приводят к образованию процессированных или <обрезанных> белков, часто
служит механизмом регуляции активности генов в процессе перехода от тканей
эмбриона к взрослым тканям.
<Работу: лучше рассматривать как открытие первого фрагмента гораздо более
крупного "Розеттского камня", необходимого для расшифровки альтернативных
сообщений нашего генома. Ожидаемая волна обширных массивов данных, созданных
с применением высокопроизводительных технологий, должна вскоре предоставить
возможности уточнения кода>, - заключают в своем комментарии к статье
коллеги авторов Рамон Техедор (Ramon Tejedor) и Хуан Валькарсел (Juan
Valcarcel) из университета Помпеу Фабра (Испания).
--
Дискуссионный лист сайта Bessmertie.Ru
По статье получается, что интроны управляют альтернативным сплайсингом?