Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

За 2012-12-15

Re: МЕХАНИЗМ РЕПАРАЦИИ ДНК

Да, удивительно. Сама форма жизни может быть примитивной по своим реакциям
и взаимодействию с окружающим миром, но в её ядре работает достаточно
продвинутая логика, разумность. Молекулярная умная машина, которая ищет,
считает, анализирует и оперирует.

   2012-12-15 09:13:58 (#2630902)

МЕХАНИЗМ РЕПАРАЦИИ ДНК

Saturday, December 15, 2012
Здравствуйте, science.
Good morning, afternoon, evening, science.

http://science.compulenta.ru/727878/

Репарирующие белки скользят по ДНК
14 декабря 2012 года, 17:07 | Текст: Кирилл Стасевич | Послушать эту новость

В любой клетке, будь она бактериальной или эукариотической, ДНК постоянно повреждается.
Спираль ДНК рвётся, из неё выпадают фрагменты, одни нуклеотиды меняются на другие.
Обильные повреждения сопровождают деление клетки, когда наследственный материал
удваивается. И одновременно с репликативными молекулярными машинами в клетке
постоянно работают белки систем репарации.

Таковых в клетке несколько, и одна из самых употребляемых -- система пострепликативной
репарации, когда необходимо восстановить повреждения уже после того, как ДНК
удвоилась. Этот механизм не предполагает узнавания дефекта: он просто вырезает
повреждённый участок из ДНК. Если в повреждённом месте были не нуклеотидные замены,
а разрыв или пробел, белки пострепликативной репарации расширяют неправильно
скопированную или повреждённую зону, чтобы проще было заменить испорченный участок.

Формирование нити ДНК-RecA в месте повреждения (здесь и ниже иллюстрации Kaushik
Ragunathan / Harvard Medical School).

Суть репарации состоит в том, чтобы на место образовавшейся бреши вставить правильный
фрагмент ДНК. И главный участник процесса известен давно -- это белок RecA (белок
бактерий, но его гомологи есть и у эукариот). RecA работает так: он садится на
ту цепь ДНК, которая осталась целой, причём много молекул белка покрывают всю
цепь, оставшуюся без напарника. Получается этакая ДНК-белковая нить, которой
необходимо найти комплементарный кусок среди неповреждённых нитей ДНК. Поскольку
в бактериальной клетке почти постоянно идёт удвоение ДНК, целые копии определённо
есть. Но вот как белок отыскивает нужную последовательность в куче других? Ведь
это всё равно что искать иголку в стоге сена.

По одной из теорий, молекулы RecA анализируют сразу несколько фрагментов, чтобы
определить их сходство с нарушенной последовательностью, -- и не так давно эта
идея получила экспериментальное подтверждение. Но, как пишут в журнале eLife
исследователи из Иллинойсского университета (США), есть ещё один механизм работы
RecA. Во втором случае белок вместе с нитью ДНК, на которой он сидит, начинает
последовательно сканировать нити ДНК на предмет использования в качестве шаблона
для залатывания повреждения.

Обнаружение 6-нуклеотидного комплементарного фрагмента на сканируемом ДНК-шаблоне.

Исследователи увидели этот механизм с помощью метода, называемого фёрстеровским
переносом энергии, -- когда энергетический обмен между близко расположенными
молекулами приводит к изменениям в свечении флюоресцентной метки. ДНК-белковая
нить действительно ездила назад-вперёд по неповреждённой ДНК, и достаточно было
6-нуклеотидного совпадения между ними, чтобы запустить реакцию рекомбинации,
в результате которой восстанавливался повреждённый и (или) вырезанный фрагмент.

Двигаясь по ДНК-шаблону, комплекс RecA может проверить около 200 нуклеотидов.
Авторы статьи утверждают, что такие скольжения ускоряют процесс репарации в 200
раз. Скорость тут является важным параметром, так как, если бы репаративная машина
работала медленно, в генах быстро накапливались бы повреждения. Как соотносятся
эти механизмы, одновременного перебора и скольжения, пока не ясно, но, вполне
возможно, что они действуют одновременно. Репарация ДНК -- такое дело, что <<лишние>>
усилия всяко лишними не будут.

Подготовлено по материалам Иллинойсского университета.

   2012-12-15 07:22:00 (#2630844)

ТЕСТ НА РИСК СМЕРТИ

Saturday, December 15, 2012
Здравствуйте, science.
Good morning, afternoon, evening, science.

http://science.compulenta.ru/727931/

Способность садиться на пол и вставать коррелирует с риском смерти
14 декабря 2012 года, 18:21 | Текст: Дмитрий Целиков | Послушать эту новость

Простой проверки опорно-двигательного аппарата может оказаться достаточно для
предсказания риска смерти в ближайшее время.

Клаудиу Жил Араужу из клиники лечебной физкультуры Clinimex в Рио-де-Жанейро
(Бразилия) и его коллеги попросили 2 002 мужчин и женщин возрастом от 51 до 80
лет просто-напросто сесть на пол, а затем подняться без посторонней помощи. Скорость,
с которой выполнялось задание, не фиксировалась. После этого за участниками эксперимента
следили в среднем 6,3 года -- до 31 октября 2011-го (или до момента смерти).

http://www.youtube.com/watch?v=MCQ2WA2T2oA&feature=player_embedded

Каждое из двух движений (сесть и встать) оценивалось по пятибалльной шкале (пять
-- высшая оценка) в зависимости от того, чем человек себе помогал (например,
опирался на руку или колено). За каждую такую помощь снималось полбалла или целый
балл (подробности -- на видео). Результат складывался, и в зависимости от набранных
очков участники попадали в одну из четырёх групп (первая -- 0-23 балла, вторая
-- 3,5-25,5, третья -- 6-27,5, четвёртая -- 8-210).

В период исследования скончалось 159 человек, то есть показатель смертности составил
7,9%. Большинство покойных набрали очень мало очков, а из числа справившихся
на твёрдую <<десятку>> умерли только двое. В целом выживаемость в четырёх группах
значительно различается даже с поправкой на возраст, пол и индекс массы тела:
риск умереть в первой группе в 5-26 раз выше, чем в четвёртой. В первых трёх
группах в целом риск в 2-25 раз выше. Каждый балл повышает шансы на выживание
на 21%.

О том, что способность организма удовлетворять потребность в кислороде связана
с выживаемостью, известно давно. Так называемое аэробное соответствие (aerobic
fitness) как раз и выражается в гибкости тела, мышечной силе, отношении поднимаемых
тяжестей к весоростовому коэффициенту, координации движений. На бытовом уровне
это проявляется в способности выполнять простые повседневные задачи: нагнуться
за газетой, дотянуться до очков и др.

При этом тест не требует никакого оборудования, совершенно безопасен (хотя страховать
стариков всё-таки надо, конечно), выполняется за пару минут и имеет простую оценочную
шкалу.

Результаты исследования опубликованы в издании European Journal of Preventive
Cardiology.

Подготовлено по материалам Европейского кардиологического общества.

   2012-12-15 07:18:04 (#2630843)