Теперь бери оттуда и в программу грузи. Можешь фотку экрана сделать?
Александр Кушелев, [30.06.2024 13:32]
Я копирую с сайта нуклеотидную последовательность в формате fasta и сохраняю в папку 00001, которая находится в той же папке, что и программа Binary_SS
Инвестор S, [30.06.2024 13:18]
Что показывает программа?
Александр Кушелев, [30.06.2024 13:23]
На экране она сообщает, что сделала работу
В одну папку она сохраняет компактное представление вторичной структуры белка.
А в другую папку - развёрнутое представление вторичной структуры белка:
Это - фрактальная спираль с плавными поворотами.
Повороты осуществляются на метиониноах (Met) (сиреневый) и на кодах 310-спирали (оранжевый).
Инвестор S, [30.06.2024 13:36]
В 3д перерисовать сможем ?
Александр Кушелев, [30.06.2024 13:37]
Сейчас программист начал делать 3D модуль, но это ещё не скоро будет закончено. 3D - самый сложный алгоритм
Те 3D, которые были до этого, пригодны только для некоторых классов белков, в которых нет пролинов и метионинов. И то неточно
Транспозиционный угол в аминокислотах не кодируется, поэтому без моделирования физики процесса точной 3D модели не получится.
Инвестор S, [30.06.2024 13:39]
Тогда давай фотки тех, которые уже отрендерены. Какие это белки? Надо сказать что через n дней грубо говоря будет так :
Кушелев: Могу предложить 100 3D моделей белков из приложения к книги "Пикотехнология белков".
Инвестор S, [30.06.2024 13:41]
Давай. Ты пишешь: "Транспозиционный угол в аминокислотах не кодируется, поэтому без моделирования физики процесса точной 3D модели не получится."
Вот это моделирование я могу сделать, по вычислительным мощностям. Именно физику процесса. Нужны алгоритмы и добавить фактор корреляции обязательно.
Кушелев: Алгоритмы так просто не напишешь. Это большая работа...
Инвестор S: т.к. это всё норсит разумеется вероятностный характер
Кушелев: Что это?
Короче, внедрение нужно начинать со схем 2D-структур белков. А на вырученные деньги можно будет и 3D модуль закончить.
На определение структуры этого белка, состоящего из 97 тысяч аминокислотных остатков, программа потратила меньше секунды.
Если распаковать архив, то там будет 100 папок. В каждой папке есть код белка в формате fasta и 3D модели в виде картинок и AVI
Приглашение к сотрудничеству
На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.
По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.
Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"
Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.
Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.
Инвестирование научных проектов
Приглашаем инвесторов и меценатов.
Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?
- Вложить деньги в научные разработки.
Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, высокие технологии.
Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.
Готовые коммерческие продукты
1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY
2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки
3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов
4. Технология изготовления сапфировых линз
5. Магнитный тороидально-сферический конструктор
Проекты
01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)
02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии)
03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)
04 Октаэдрический редуктор
05 Шестеренчатая передача Кушелева
06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей
07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель
08 Гибкий отражатель из жестких элементов
09 Энциклопедия "Наномир"
10 Экспертиза
11 Конструктивные компьютерные игры
12 Интеллектуальный кодовый замок
13 Очки кругового обзора
14 Тетраэдрический сканер
15 Программируемая архитектура
16 Источник энергии промышленной частоты
17 Источник энергии постоянного тока
18 Монокристаллическая видеокамера
19 Система определения активных участков белка
20 Тераваттный лазер непрерывного действия
21 Бактериальный синтез алмазов
22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы
23 Сверхсветовая связь
24 Безосевая шестеренчатая передача
25 Aктивный язык программирования
26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов
27 Микроволновая архитектура
28 Компьютерный экран из автономных элементов
29 Чтение / запись ДНК
30 Сверхсветовая локация / зрение
31 Нейтрализатор акустического сигнала
Коммерческое предложение:
Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.
Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).
В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка.
Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.
Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.
Сотрудничество может быть различным:
- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)
- совместное создание коммерческого продукта
- поиск инвесторов
- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов
- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир
- содействие в проведении экспериментов и т.п.
- написание совместных научных статей и т.п.
- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)
Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.
