Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

1337 Создана быстродействующая программа для анализа структуры белков!


Выпуск 1337
2024-06-11

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Создана быстродействующая программа для анализа структуры белков!

Предыстория

 

Оригинальный размер 

6 June 2024 05:41 Роман: Александр, здравствуйте!

Вчера обнаружил ряд файлов fasta, в которых есть символы, отличные от acgtACGT. Комментарий в первой строке в расчет не беру, само собой.

В нескольких файлах встречаются символы 'n' и 's'.

Хочу понять, это ошибка?

10:40 Александр Кушелев: Символ n означает, что нет данных, т.е. неизвестен реальный символ. В этом случае нужно обозначать результат черным элементом, как здесь: 

 

Что такое символ s, я пока не знаю. Буду выяснять. Ошибки тоже бывают, т.е. может встретиться любая абракадабра. Главное, чтобы программа на этой абракадабре не останавливалась. В нашем случае одна структура белка мало что меняет. Поэтому непонятный белок нужно просто проигнорировать, но так, чтобы я это заметил. Например, непонятные символы изобразить черными графическими элементами. А в программе анализа это будут иксы, т.е. неизвестно что.

Вот, что написано в описании стандарта: These will be stripped from the sequence. Use the IUPAC approved symbol "N" for ambiguous characters instead.

Автоперевод: Они будут удалены из последовательности. Вместо этого используйте одобренный IUPAC символ «N» для неоднозначных символов.

Подробнее: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/fastaformat/

15:15 Роман: У нас при построении кода-4 из fasta есть такая таблица соответствий:

Aa -> 0
Cc -> 1
Gg -> 2
Tt -> 3

Нужно как-то этот метод доработать. Что нужно возвращать, в случае нахождения символов, отличных от вышенаписанных?

Эти числа у нас потом участвуют в формировании индекса для таблицы кода-4 из триплета по формуле: d1*16 + d2*4 + d3

15:54 Александр Кушелев: Придётся возвращать 4. Это равнозначно стоп-кодону

Что возвращается в случае стоп-кодона? Вот его и возвращать :)

16:55 Роман: Ок.

8 June 2024 09:53 Роман: Binary_SS.rar 15.3 MB

Здравствуйте, Александр!

А вот и подъехала новая версия программы, которая умеет создавать цветную графику для кода-4.

В файле конфигурации появился параметр, который включает/отключает создание цветной графики. Графика сохраняется в папку images, что создается в корневой папке программы.

В проекте появился файл opencv_world490.dll, его наличие обязательно, это динамечески линкуемая библиотека OpenCv

Изображения с цветной графикой именуются следующим образом: folderId_fastaName.jpeg

например: 00001_ECI1_YEAST.jpeg

09:57 Александр Кушелев: Класс!

09:57 Роман: На мой скромный взгляд, скорость работы более, чем достойная

09:58 Александр Кушелев: Надо проверить…

09:58 Роман: Да, проверьте, там еще явно потребуется доработка вывода графики, сейчас я вывожу цветные квадраты и цифры в них. Самое главное не скинул, исполняемый файл забыл в архив добавить, сейчас пришлю.

10:01 Александр Кушелев: Я у компа буду завтра, поэтому интересно увидеть пример графически файла

10:02 Роман: Сейчас скину архив с папкой с картинками, что получаются

10:03 Александр Кушелев: Нужна одна картинка без архива

10:05 Роман: Binary_SS.rar 63.7 KB исполняемый файл

10:05 Александр Кушелев: И картинку не в архиве

10:05 Роман: 00001_ECI1_YEAST.jpeg 77.5 KB

10:06 00021_AAC50349.jpeg 277.2 KB

10:07 00102_AAA60019.jpeg 281.2 KB

10:07 Александр Кушелев: Здорово! А можно вверху добавить имя файла?

10:07 Роман: да, без проблем

10:08 00116_CAA36267.jpeg 783.7 KB

10:08 00254_XM_049996536.jpeg 250.1 KB

10:08 Александр Кушелев: Самое актуальное - переход на код 9

10:09 Роман: из кода-4 можно получить код-9 ? У нас еще такого не сделано в программе. нужен будет алгоритм.

10:10 00334_KOX80029.jpeg 366.6 KB

Внизу файла наблюдаем ряд недопустимых символов N, я их вывел серым, на черном не видно текста

10:10 00356_OWF54796.jpeg 297.6 KB

10:11 00369_QCE10416.jpeg 159.5 KB

10:32 Александр Кушелев: Код 9 отличается от 4 тем, что метионин обозначается сиреневым, пролин желтым, если код 2 повторяется 3 раза подряд и более, то обозначается темно-зелёным. Если код 3 повторяется 5 раз подряд и более, то обозначается темно- синим. Если код 1 повторяется 4 раза подряд и более, то обозначается красным, иначе розовым

Серым отлично! Потом нужно будет заменить цифры на однобуквенное обозначение аминокислот.

Программа - супер! Осталось проверить быстродействие. Сколько времени делается цветная графика по сравнению с черно-белой?

10:49 Роман: Не сильно дольше, если рассматривать в отрыве от расчета корреляции, то для 500 папок графика строится за 10-15 секунд. Но у нас это происходит в процессе расчета корреляции, так что работать будет по времени почти так же, как программа работала до ввода цветной графики. Возможно, чуть дольше.

10:51 Александр Кушелев: Круто!

15 секунд это сколько картинок?

10:51 Роман: 500шт

10:52 Александр Кушелев: Кстати, можно в конфиге отключать расчёт корреляции?

Класс!

10:53 Роман: Нет, сейчас нельзя такого делать, но, можно добавить.

11:13 Александр Кушелев: Отлично! Это уже актуально

9 June 2024 10:59 Роман: 

Binary_SS.rar 15.4 MB Новая версия программы

что нового:

- расчет корреляции стал опциональным и регулируется через конфигурацию;

- при создании изображений на них подписывается имя файла FASTA;

12:10 Александр Кушелев: ОК! Благодарю!

Сейчас потестирую. Следующая по актуальности задача - заменить цифры на однобуквенный код аминокислот.


Этот код программа Binary_SS выводит в третий столбец. Называется ami

Класс!

Первое по актуальности - нужно раскрашивать картинки по коду-9. Второе по актуальности - заменить цифры на код ami.

13:16 Роман: Давайте тогда обсудим, как нам реализовать проще код-9.

Как я понял можно получить из кода-4 и из файла fasta? Какой из вариантов проще?

Если нужно реализовать промежуточные состояния, то можно и их сделать.(Насколько помню, например, код-8 есть некий)

Возможно, у Вас уже есть готовый алгоритм, тогда проще будет

13:34 Александр Кушелев

Повтор от 08.06.2024 10:32:31

Код 9 отличается от 4 тем, что метионин обозначается сиреневым, пролин желтым, если код 2 повторяется 3 раза подряд и более, то обозначается темно-зелёным. Если код 3 повторяется 5 раз подряд и более, то обозначается темно- синим. Если код 1 повторяется 4 раза подряд и более, то обозначается красным, иначе розовым

Цвета можно посмотреть здесь: 

 

Подробнее

В программе на Матлабе каждый цвет имеет свой цифровой код, но это нигде не понадобилось. Поэтому не вижу смысла, чтобы обозначать красный единицей, а розовый - пятёркой. Это же относится и к парам "светло-зелёный — тёмно-зеленый" и "голубой-синий". Разные цифры для более светлых и более тёмных цветов будут нужны при создании 3D-модуля программы, т.к. для них будут отличаться углы. Но и там не факт, что это понадобится.

Так что ограничимся кодом-4 для цифр и будем называть кодом-9 только цветное отображение, т.к. цветов получается 9.

розовый-красный, салатовый-зеленый, голубой-синий, сиреневый (для метионина), желтый (для пролина). И 9-ый цвет - оранжевый.

На самом деле есть и 10-ый цвет. Серый. Его же можно использовать и как символ окончания постройки белка, т.е. последний.

Так что на самом деле Вы будете программировать код-10. По количеству разных цветов. Думаю, что из кода-4 код-10 получится проще. Но Вам виднее :) Промежуточные варианты уже не актуальны. Они получались в процессе исследований. Так что нужен только код-10.

14:49 Роман: Нам все равно как-то нужно будет получить кодовое представление, чтобы построить картинку. Без этого никуда, к сожалению... Подозреваю, что придется нам снова корпеть над алгоритмом с рядом проверок и счётчиков. Или, может, Валентин поделится алгоритмом? Нужен алгоритм, который словами просто описывает требования получения кода-9 из кода-4. Примерно в том же ключе, как мы с Вами код-1 получали из кода-4. Был ряд условий и мы их закодировали программно.

Нам этот код нужен не для подписей даже, для цветов исключительно. Нужно четкое сопоставление Цифра -> цвет. Подписи все равно будут ami

Попробую вот по этому описанию алгоритм сделать, но пока не уверен, что получится

Кстати, можете ещё скинуть, скажем, 5 изображений, которые программа Валентина создаёт? Например, для первых пяти папок 00001-00005

15:14 Александр Кушелев: "Или, может, Валентин поделится алгоритмом?"

Кушелев: Так я же Вам сказал алгоритм. Тот же, что и Валентину: "метионин обозначается сиреневым, пролин желтым, если код 2 повторяется 3 раза подряд и более, то обозначается темно-зелёным. Если код 3 повторяется 5 раз подряд и более, то обозначается темно- синим. Если код 1 повторяется 4 раза подряд и более, то обозначается красным, иначе розовым"

Если Вам удобно обозначать разные цвета разными кодами, то вот таблица ещё раз:

1 - красный
2 - зеленый (тёмный)
3 - синий (тёмный)
4 - оранжевый
5 - розовый
6 - сиреневый
7 - голубой
8 - салатовый
9 - желтый
10 - серый

На самом деле это неудобная нумерация. Поэтому Валентин долго возился с программированием.

Можно сделать другую нумерацию, тогда будет проще.

В коде-4 используется 4 цвета + серый.

Давайте поменяем цвета для кода-4.

1 - розовый
2 - салатовый
3 - голубой
4 - оранжевый

А теперь добавляем алгоритм кода-10.

Если код-1(может встречаться и код 4) повторяется больше 3 раз, то становится кодом-5 (красный)

Если код-2 повторяется больше 2 раз, то становится кодом-8 (тёмно-зеленый)

Если код-3 повторяется больше 4 раз, то становится кодом-7 (синий)

Метионин (триплет ATG, ami = M) - код 6 (сиреневый)

Пролин (триплеты CCA, CCC, CCG, CCT; ami=P) - код 9 (желтый)

Ну и серый.

Ваши цвета не обязаны точно повторять цвета программы Валентина. Там я слишком усложнял. Сейчас скину картинки для 5 первых папок.

2024060902.rar 20.6 MB

Это всё, что делает программа Валентина.

Кстати, нам будет актуально ещё такая доработка программы Binary_SS. Сейчас она берёт из каждой папки по одной фасте. А мне будет нужен режим, когда программа должна брать все фасты из одной папки.

15:58 Роман: Окей, буду пробовать это запрограммировать

Это про построение картинок речь?

15:59 Александр Кушелев: Да. Только картинки.

Может быть для этого имеет смысл сделать отдельную программу

16:00 Роман: То есть, у нас будет, скажем, одна папка, в ней тысячи файлов фаста. Их обрабатываем, получаем на выходе папку с таким же количеством картинок

Да, наверное, лучше отдельную. FastaToImage что-то такое

16:05 Александр Кушелев: Да, только желательно, чтобы в папке могло быть больше 1000 файлов. У меня бывает и 20 000. А если это сильно замедлит работу программы, то нужна будет программа, которая разложит из папки, например, до 100 000 файлов в 100 папок по 1000. Ну и тогда нужно будет обрабатывать все эти 100 папок подряд и делать 100 папок с картинками

Да. Точно!

9 June 2024 16:06 Роман: Не, по количеству файлов проблем не будет, это я для примера написал. Хоть тысячи, хоть сотни тысяч.

16:06 Александр Кушелев: Программа Валентина после первой тысячи фаст начинает сильно тормозить. Поэтому я раскладываю вручную по 1000 файлов в разные папки

16:07 Роман: Я думаю, что у нас такого не будет. Точно не ручаюсь, но почти уверен

Тесты покажут

16:09 Александр Кушелев: ОК

Если по алгоритму код-10 будут вопросы, сразу задавайте, чтобы время не терять

16:10 Роман: Окей. 

 

 

 


Хорошо бы на работу не ходить, и чтобы деньги были... 

[22:24, 05.06.2024] Александр Кушелев: Для меня это важнее всех остальных тем. А как я напишу олигарху? Он вряд ли прочтёт.

[22:24, 05.06.2024] БКЧ: Я с ним не общаюсь. Ссылку найди и всё.

[22:25, 05.06.2024] Александр Кушелев: Другое дело если ...

[22:25, 05.06.2024] БКЧ: Так… ***** Чо тогда то? Все сдохнем?

[22:26, 05.06.2024] Александр Кушелев: Это понятно. Тут важно на связь выйти. А дальше будет видно, интересно ему, будет слушать объяснение или "никому не верю, ничего не знаю..."

[22:27, 05.06.2024] Александр Кушелев: "Чо тогда то?"

-Ну так молодость-то вернём, а дальше придумаем что-нибудь. Например, нужно "всего-ничего", "скатерть-самобранку" доделать. :)

Я много разных писем писал. Никто их не читает. Тут нужно связь установить. Это "игольное ушко".

[22:29, 05.06.2024] БКЧ: Так…. Я не при делах

[22:29, 05.06.2024] Александр Кушелев: Ну так интеллект-то работает. Женского типа.

[22:30, 05.06.2024] БКЧ: У тебя?????

[22:30, 05.06.2024] Александр Кушелев: Придумай, как организовать нашу с ним связь.

[22:30, 05.06.2024] Александр Кушелев: У меня только мужского типа есть. :)

[22:30, 05.06.2024] БКЧ: Подумай.

[22:31, 05.06.2024] Александр Кушелев: Если бы я мог эту проблему решить, я бы уже вышел на контакт с кем-нибудь из потенциальных инвесторов.  Пока не получалось ни разу. Я так понял, что только через личные контакты можно просочиться.

[22:32, 05.06.2024] БКЧ: Ну вот давай

[22:32, 05.06.2024] Александр Кушелев: Возвращение молодости сразу поможет избавиться от десятков тысяч возрастных болезней.

[22:32, 05.06.2024] БКЧ: Просачивайся.

[22:32, 05.06.2024] Александр Кушелев: Ага. Я не умею просачиваться. Зато умею делать научные открытия и даже создавать технологии

[22:33, 05.06.2024] БКЧ: Ну тогда сиди старым раз не умеешь.

[22:33, 05.06.2024] Александр Кушелев: Надо объединить усилия.

[22:33, 05.06.2024] БКЧ: Все, я спать…. Завтра тебе напишет *****

[22:34, 05.06.2024] Александр Кушелев: ОК. Спокойной ночи!

[22:35, 05.06.2024] БКЧ: Обратись к нему

[22:38, 05.06.2024] Александр Кушелев: Тут нужно головой работать :)

[11:03, 06.06.2024] БКЧ: Мне сомнительно что ты ищешь инвесторов не на одну идею и на все подряд

[11:09, 06.06.2024] Александр Кушелев: Я ищу инвесторов на каждое научное направление, но дивиденды они будут получать, если начнёт приносить прибыль хотя бы одно.

[11:19, 06.06.2024] БКЧ: Ясно! Таким миллионерам твои дивиденды на х не нужны. 14 миллионов тебе дадут и будут ждать у моря погоды. Смешно

[12:08, 06.06.2024] Александр Кушелев: Для инвесторов "купи-продай", конечно смешно. А венчурные инвесторы понимают, что вложив миллион у.е. в случае удачи можно получать 2.5 триллиона у.е. ежемесячно. Только за счёт омоложения пенсионеров. Согласись, есть над чем подумать. А Илон Маск за свою вечную молодость мог бы и больше заплатить ;) У него каждая взорвавшаяся ракета стоит не один миллион баксов.

[12:09, 06.06.2024] БКЧ: Я занята сорри

10 June 2024 14:32 БКЧ: https://nanoworld88.narod.ru/data/474.htm

Это какое то махание руками. Никакой доказательной базы нет.. Просто вот типа есть формула и она верна. А почему — непонятно

Мне он ответил.

14:38 Александр Кушелев: А ты предложи ему подставить в формулу конкретные номера для n. Что у него получится, если n=1 и n=2. Вот и будет доказательство :)

Может даже сама подставить и написать ему, что у тебя (как великого математика современности) уже получилось. Теперь его очередь подставлять целые числа вместо n.

14:41 БКЧ: И что дальше будет? Новые законы?

14:41 Александр Кушелев: Конечно! Число n может быть любым. От нуля и до бесконечности!

14:41 БКЧ: И что?

14:41 Александр Кушелев: И все новые законы с n=3,4,5.... - это законы Кушелева :)

14:42 БКЧ: Так….. мне дай один

Закон имени бкч

14:42 Александр Кушелев: А каждый желающий может их все проверить, как в своё время проверили закон сохранения импульса и второй закон Ньютона

Подставляй для начала n=0

14:42 БКЧ: Лень

14:42 Александр Кушелев: Получишь частный закон проницаемости Кушелева

14:43 БКЧ: Спать хочется

14:43 Александр Кушелев: Ну попроси дочку, если ей не лень формулу из нескольких символов написать :)

Спокойной ночи, точнее вечера. А я купаться иду...

14:43 БКЧ: Дочки на работе день и ночь

Я сижу на квартире у дочки с мастером тут по кондиционерам

Видишь ли ей душно

14:44 Александр Кушелев: Ну тогда читай свежий выпуск рассылки: https://subscribe.ru/catalog/science.news.nanoworldnews

Должно понравиться

14:45 БКЧ: Лень

С ***** болтать буду

14:45 Александр Кушелев: Это правильно! А про лень я тебе потом анекдот расскажу. Не очень приличный...

14:45 БКЧ: Ну вот! Чем я не Алла Пугачева то

14:46 Александр Кушелев: В смысле?

14:46 БКЧ: 30 лет разница тьфу фигня

14:46 Александр Кушелев: Ты имеешь в виду Галкина?

Ты рассылку прочитай. Там как раз про то, как молодость вернуть. Пугачёва прозевала. Я ей лично писал и в рассылке дублировал.

14:46 БКЧ: Да

Пугачева прозевала все ! 

14:48 Александр Кушелев: Вот письмо для неё было: https://nanoworld88.narod.ru/data/267.htm

14:48 БКЧ: Так ей непонятно такое

14:48 Александр Кушелев: А тут ещё подробнее с иллюстрациями: https://nanoworld88.narod.ru/data/335.htm

Я вчера объяснял одной знакомой. Она поняла: https://subscribe.ru/archive/science.news.nanoworldnews/202406/09212312.html

Это - вторая тема в рассылке

14:49 БКЧ: Да крупно надо было написать!!!!!

Хочешь нового молодого мужа????? - читай это

А не так

Будет она читать про лабораторию

Олигарху напиши

14:50 Александр Кушелев: Ну всё, я купаться. Напиши, как правильно, вместе пошлём. И свою фотку в лет 20 более высокого качества найти. А то как-то не очень видно...

14:50 БКЧ: "Хочешь покорить БКЧ???? - зыркай сюда"

14:50 Александр Кушелев: Я сомневаюсь, что он прочтёт письмо от неизвестного ему человека

14:51 БКЧ: Sticker 16.4 KB

14:51 Александр Кушелев: Ты письмо составь, а я ему перешлю. Посмотрим, получится ли?

14:51 БКЧ: Куда перешлешь? Нет его почты у меня

14:51 Александр Кушелев: Куда скажешь, туда и перешлю. И подпись свою добавлю, если нужна

14:51 БКЧ: Ок.

14:52 Александр Кушелев: Всё, пошёл, а то гроза будет, не поплаваешь...

14:52 БКЧ: Давай

16:02 Александр Кушелев: Ты, как преподавательница математики, объясни своему ученику, чем отличается множество от элемента множества. Общий закон Кушелева - это семейство или множество законов, причём бесконечное, т.е. кроме таких элементов, как закон сохранения импульса и второй закон Ньютона, в этом множестве содержится ещё бесконечное количество аналогичных элементов. Один из них - частный закон Кушелева, который получается из общего при n=0

16:03 БКЧ: Что ты все всеобщие истины говоришь-то?

Мы что придурки что ли… по твоему мнению?

Sticker 23.1 KB

Где обоснование этих законов?

Что они справедливы и выполняются

16:04 Александр Кушелев: Ты имеешь в виду, например, при n=0 ?

16:04 БКЧ: К чему нам эти законы?

16:04 Александр Кушелев: А к чему тебе закон сохранения импульса?

16:04 БКЧ: При n=[3;oo)

И где обоснование твоей методы омоложения?

16:05 Александр Кушелев: С помощью этого закона (сохранения импульса) можно рассчитать скорости объектов после взаимодействия. А с помощью частного закона Кушелева можно рассчитать расстояния (координаты).

16:06 БКЧ: Ну поясни это подробно *****

16:06 Александр Кушелев: У тебя есть сомнения, что при n=3 равенства не будет?

16:06 БКЧ: Мне вообще все равно, с ним разбирайся

16:07 Александр Кушелев: Если ты не хочешь быть более крутым математиком, чем твой ученик, тогда нет проблем :)

16:07 БКЧ: Не хочу. А то я перестану им восхищаться...

16:07 Александр Кушелев: Что касается обоснования омоложения, то тут всё просто. Если удалось отключить один уровень механизма, то что мешает отключить остальные 13 ?

16:07 БКЧ: Sticker  20.2 KB

)

Похожа киса на орла...

16:08 Александр Кушелев: ты его математическими способностями восхищаешься?

16:08 БКЧ: Конечно! Больше нет преимуществ

16:08 Александр Кушелев: ОК

16:09 Александр Кушелев: А то прикинь, возраст вернём, математические способности "не очень", и придётся тебе нового ученика искать?

А тебе же лень...

16:10 БКЧ: Sticker 23.1 KB

Весело?

16:11 Александр Кушелев: У тебя киски, конечно, прикольные, но ... я тебе ща другую покажу...


16:12 БКЧ: Фотошоп

16:12 Александр Кушелев

Нет. https://medach.pro/post/2053

Я тебе могу ещё разнополых химер показать. С фрактальными руками. И это тоже реальность.

16:13

Но позже

Продолжение следует... 

 


Приглашение к сотрудничеству

На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.

По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.

Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"

Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.

Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур  и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.


 

 

Инвестирование научных проектов

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.


Готовые коммерческие продукты

 

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

Telegram: https://t.me/nanoworldlab

Приглашение в группу: https://t.me/nanoworld_discussion 

WhatsApp: +7 926 850-54-22

mail: kushelev20120@yandex.ru


О способах финансирования можно спросить по электронной почте и на телеграм-канале. 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку! 


В избранное