Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

964 Обсуждение будущей научной статьи о пикотехнологии.


Выпуск 964

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Обсуждение будущей научной статьи о

пикотехнологии.

[13:02, 21.01.2023] Профессор: Начну с тезисов... 

[13:02, 21.01.2023] Александр Кушелев: Интересно будет видеть промежуточные результаты. Это поможет заметить, если "что-то пойдёт не так" :) Вы видели, какие шедевры вторичной структуры обнаруживаются? Пока РСА, ЯМР и др. методы не могут обнаружить ни одной фрактальной спирали белка. Даже 75-спираль называют бета-призмой


[13:05, 21.01.2023] Профессор: Конечно, будем во взаимодействии. Изучаю пикотехнологические модели аминокислотных остатков.

[23:12, 22.01.2023] Александр Кушелев: Респект! Я раньше думал, что кольцегранные модели - это панацея от неопределённости углов между химическими связями. Но после создания суставно-стержневого конструктора стало ясно, что с его помощью удаётся определять углы гораздо быстрее и легче. Речь идёт об углах, которые фиксируются водородными связями. Например, при переходе от альфа-спирали к 310-спирали или обратно суставно-стержневой конструктор просто, легко и точно показывает, что водородные, а точнее водородно-вандерваальсовы связи расщепляются. Именно расщепление на водородные и вандерваальсовы связи даёт жёсткость структуры при переходе альфа-310 или 310-альфа. Это же относится и к другим переходам. На кольцегранных моделях я этого не заметил по той простой причине, что они более громоздкие. А тут очевидно, что одна связь не даст жёсткости. Разбираясь с этой проблемой я понял, что связь расщепляется. При этом спираль изламывается на конкретный угол. Его легко померить на суставно-стержневой модели. А позднее таблицу углов можно будет включить в состав 3D модуля программы "Пикотехнология". Это позволит правильно строить пространственные модели белков по таблице углов перехода. Но и это не последний шаг. Пролин даёт гибкость по третьей оси, поэтому придётся создавать "пролиновый тюнинг", как, впрочем и тюнинг (настройку) по второму углу изгиба аминокислот. Кодируется лишь один угол, композиционный. Второй (транспозиционный) угол изгиба полуацетали не кодируется, а определяется "на месте". Так же определяется "на месте" и пролиновый угол. Всё это запрограммировать - дело тонкое.  Нужен программист, например, Евгений Неделько. Будет инвестор, найдём.

[23:26, 22.01.2023] Профессор: На почту про пролин материал высылайте. Мне надо разобраться.

[23:27, 22.01.2023] Александр Кушелев: У меня всё опубликовано в рассылке, поэтому я могу просто ссылки давать на нужный материал.

[23:27, 22.01.2023] Профессор: Список названий статей пока не пишу. Изучаю пикотехнологические модели. И книгу тоже присылайте по Пикотеху. Перевод на правильный английский обходится по 1000-1500 за страницу.

[23:32, 22.01.2023] Александр Кушелев: 1500 не проблема


По шкале из самых мелких шариков откладывается композиционный угол. По шкале из средних шариков - транспозиционный угол. По шкале из крупных шариков - пролиновый угол. Эти три угла лежат в попарно ортогональных плоскостях. Интерес представляет тот факт, что любой аминокислотный остаток может деформироваться не только на транспозиционный угол, но и на пролиновый. Другое дело, что пролиновая деформация обычных аминокислотных остатков не превышает 10 градусов. Если же требуется больше, то очередной аминокислотный остаток заменяется на пролин (Pro), и диапазон пролиновой деформации увеличивается от +-10 до +-60 градусов. В результате зона роста белковой молекулы охватывает более 2/3 полного телесного угла.

Сейчас найду анимашки, где дискретно меняется композиционный угол (первый), плавно транспозиционный (второй) и плавно пролиновый (третий). Вот, нашёл: http://www.nanoworld88.ru/files/700-800/730.htm

 

 

Я думаю, что об этом механизме с тремя углами и о суставно-стержневом конструкторе нужно писать где-то ближе к концу последней статьи. Но понимать это желательно уже сейчас :)

Книга, которую написала Виктория Соколик: https://disk.yandex.ru/i/MAjmBiT1xbtUV

Я сначала не понял, что у неё была за проблема с вращением второй аминокислоты относительно первой. Это выяснилось уже после выхода книги в печать :)

Виктория не поняла вот что: "угол поворота тРНК не совпадает с углом между остатками аминокислот в альфа-, 310-, пи-, бета-спиралях"

Я просто не мог себе этого представить :) Я пытался ей объяснить азы геометрии уже после выхода книги в печать: http://nanoworld88.ru/files/600-700/638.htm

Надо долистать до заголовка:  "Фолдинг есть, но на уровне третичной структуры белка. На уровне вторичной структуры его нет."

Я думаю, что дело пойдёт быстрее, если Вы будете задавать конкретные вопросы, а я буду присылать Вам либо простые ответы, либо ссылки на обсуждение этих вопросов, если "не всё так просто" :)

Продолжение следует... 

Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru


Приглашение к сотрудничеству

На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.

По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.

Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"

Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.

Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур  и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.

Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru


Инвестирование научных проектов

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.


Готовые коммерческие продукты

 

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703,   +7-903-2003424,  mail: kushelev20120@yandex.ru

О способах финансирования можно спросить по электронной почте. 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку! 


В избранное