Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

946 Шедевры белковой архитектуры. Часть 32


Выпуск 946

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Шедевры белковой архитектуры

 Часть 32

[22:51, 09.01.2023] Валентин: я делал тогда вот это:  JAIWYP01. Сделал и выслал тебе на почту. 2022,06,18 числа это было.

[22:55, 09.01.2023] Александр Кушелев: Странно. А почему название не совпадает? https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JANPWB010000008.1

В файле 1.5 Гб идентификаторы белков KAJ,  а те, что ты обрабатывал, начинаются с KAH. Это точно тот файл?

[23:45, 09.01.2023] Александр Кушелев: А что это за архив 002.rar ?

[23:47, 09.01.2023] Валентин: это все фасты из этого gb файла

[11:06, 10.01.2023] Александр Кушелев: Привет! Мои ожидания подтвердились. В этом файле 1.5 Gb нашлись десятки кодов фрактальных спиралей, шедевров белковой архитектуры! Так что благодарю! Жаль, что на моём компе нельзя резать крупные файлы из генбанка. Может быть можно улучшить программу, чтобы она смогла работать и на моём убогом компе?

Чтобы определить структуру каждого из этих белков, нужно проделать работу (около 10 лет), т.е. примерно такую же, как для определения структуры ДНК. 

Однако программа Пикотех 2D позволяет определить их структуру в сотни миллиардов раз быстрее! И в тысячи раз точнее...

1190-KAJ1160683-1-P-0-b1

 Фрактальная 444757-спираль на основе 310-спиральных участков. Период 6

1312-KAJ1160805-1-P-0-b1

 Фрактальная 16417555744475855P-спираль с пролиновой юстировкой. Период 18

1369-KAJ1160862-1-P-0-b1

 Фрактальная 777111417858755P41461178P5757-спираль с кратной пролиновой юстировкой. Период 29

1454-KAJ1160947-1-P-0-b1

Фрактальная 111P855857577P557575P55855P555757P-спираль на основе альфа-спиральных участков (красный) с кратной пролиновой юстировкой (желтый). Период 34.

1544-KAJ1161037-1-P-0-b1

 Фрактальная 55578-спираль. Период 5

1597-KAJ1161090-1-P-0-b1

 "Мерцающий фрактал" на основе бета-спиральных участков (зеленый). Период 10.

2220-KAJ1161713-1-P-0-b1

 Набор фрактальных спиралей на основе альфа-310-спиральных участков. Типовой период 10

2230-KAJ1161723-1-P-0-b1

Фрактальная квази-спираль на основе альфа-спиральных участков (красный) и бета-спиральных участков (зеленый).

3057-KAJ1162550-1-P-0-b1

 Фазированный фрактал на основе альфа-310-спиральных участков с метиониновой юстировкой (сиреневый).

3391-KAJ1162884-1-P-0-b1

 Фрактальная P5577557-спираль. Период 8

3595-KAJ1163088-1-P-0-b1

 Фрактальная 161478-спираль на основе альфа-310-спиральных участков с метиониновой юстировкой.

4204-KAJ1163697-1-P-0-b1

 Фрактальная 1111111117-спираль на основе альфа-спиральных участков.

4315-KAJ1163808-1-P-0-b1

Фрактальная 11418P77P5578P5585P-спираль на основе альфа-спиральных участков с кратной пролиновой юстировкой. Большой период 61, малый период 19.

5962-KAJ1165455-1-P-0-b1

 Фрактальная 3333335575-спираль на основе пи-спиральных участков (синий). Период 10.

6324-KAJ1165817-1-P-0-b1

 Фрактальная P55787857577775787857577P557878557577P55787857577775787857577-спираль. Период 60.

6546-KAJ1166039-1-P-0-b1

 Фазированный фрактал. Типовой период 5.

6552-KAJ1166045-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль. Типовой период 10.

6675-KAJ1166168-1-P-0-b1

Фрактальная 44111111714111485757857755757P7577557-спираль на основе альфа-310-спиральных участков с пролиновой юстировкой. Период 37

6841-KAJ1166334-1-P-0-b1

 Структура этого белка содержит протяженные участки альфа-310-спиралей (красный-оранжевый).

6843-KAJ1166336-1-P-0-b1

 Фрактальная 1111111144-спираль переходит во фрактальную 1111114757-спираль. Период 10 сохраняется.

6844-KAJ1166337-1-P-0-b1

Белок содержит протяженные участки альфа-310-спиралей, в т.ч. участки фрактальных 1111111144-спиралей с периодом 10.

6848-KAJ1166341-1-P-0-b1

 Блочная структура с альфа-спиральными участками (красный)

6954-KAJ1166447-1-P-0-b1

 Просматриваются участки фрактальной 22211114755-спирали с периодом 11.

7023-KAJ1166516-1-P-0-b1

 Фрактальная P7141478555-спираль. Период 11.

7058-KAJ1166551-1-P-0-b1

 Фрактальная 777141485575-спираль. Период 12.

7099-KAJ1166592-1-P-0-b1

 Блочная структура на основе альфа-спиральных участков.

7100-KAJ1166593-1-P-0-b1

Фрактальная P857785757555587555-спираль. Период 19.

 

7125-KAJ1166618-1-P-0-b1

 Фрактальная 441177855577558-спираль. Период 15.

7208-KAJ1166701-1-P-0-b1

Структура белка кончается фрактальной 441114P7P8-спиралью на основе альфа-спиральных участков (красный) с пролиновой юстировкой (желтый). Период 10.

7275-KAJ1166768-1-P-0-b1

 Фрактальная 1114857P757P877444857P75P87-спираль. Период 27.

7518-KAJ1167011-1-P-0-b1

 Фрактальная 5557557557-спираль. Период 10.

7526-KAJ1167019-1-P-0-b1

 Фрактальная P8P7414111755-спираль. Период 13.

7529-KAJ1167022-1-P-0-b1

Фрактальная 222444777-спираль (период 9) переходи во фрактальную 787611111-спираль. Период 9 сохраняется.

7532-KAJ1167025-1-P-0-b1

 Фрактальная P575575575-спираль. Период 10.

7537-KAJ1167030-1-P-0-b1

 Квази-спираль

7542-KAJ1167035-1-P-0-b1

 Фрактальная 444177557557855577557577-спираль. Период 24.

7553-KAJ1167046-1-P-0-b1

 Фрактальная 1111778755758PP55P7-спираль. Период 19.

7559-KAJ1167052-1-P-0-b1

 Фрактальная 757855-спираль (период 6) переходит в 411178-спираль (период 6).

7562-KAJ1167055-1-P-0-b1

 Квази-спираль.

7574-KAJ1167067-1-P-0-b1

 Фрактальная 111148P5P-спираль. Период 9.

7582-KAJ1167075-1-P-0-b1

 Фрактальная 44147755777855577575557-спираль. Период 23.

7586-KAJ1167079-1-P-0-b1

 Фрактальная 77111176411144175711111775-спираль. Период 26.

7589-KAJ1167082-1-P-0-b1

 Фрактальная 11118578557-спираль. Период 11.

7600-KAJ1167093-1-P-0-b1

 Фрактальная P14418557-спираль переходит в 7P7555855-спираль. Период 9 сохраняется.

7624-KAJ1167117-1-P-0-b1

 Фрактальная 4111174111147585577757877555858-спираль. Период 31.

7638-KAJ1167131-1-P-0-b1

 "Мерцающий фрактал". Период 23.

7643-KAJ1167136-1-P-0-b1

 Фрактальная 8575778577557-спираль. Период 13.

7658-KAJ1167151-1-P-0-b1

 Фрактальная 114411P557-спираль. Период 10.

7665-KAJ1167158-1-P-0-b1

 Квазиспираль.

7671-KAJ1167164-1-P-0-b1

 Фрактальная 4447757578-спираль. Период 10.

7677-KAJ1167170-1-P-0-b1

 Фрактальная 1111117575P84448585P778P7577-спираль. Период 28.

7678-KAJ1167171-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль. Фазированный фрактал. Типовой период 4.

7685-KAJ1167178-1-P-0-b1

 Фрактальная 11111788577-спираль. Период 11.

7700-KAJ1167193-1-P-0-b1

 Эта структура, вероятно, является фрактальным пико-механизмом на пролиновых суставах.

Это фрактальная 7P5P8P55P-спиральная пико-машина.

7704-KAJ1167197-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль.

7709-KAJ1167202-1-P-0-b1

 Фрактальная 7778858578-спираль. Период 10.

7715-KAJ1167208-1-P-0-b1

 В структуре этого белка пр осматриваются кластеры (пи-спиральные участки (синий))

7724-KAJ1167217-1-P-0-b1

 Фрактальная 55777788777-спираль. Период 11.

7725-KAJ1167218-1-P-0-b1

 Квази-спираль.

7727-KAJ1167220-1-P-0-b1

 Фазированный фрактал.

7740-KAJ1167233-1-P-0-b1

Структура белка заканчивается фрактальной 2227578578P57-спиралью. Малый период 13. Большой период 60.

7743-KAJ1167236-1-P-0-b1

 Вторая половина белка - фрактальная PP75P5757757-спираль. Период 12.

7743-KAJ1167236-1-P-0-b2

 Продолжение структуры.

7747-KAJ1167240-1-P-0-b1

 Фазированный фрактал.

7753-KAJ1167246-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль. Типовой период 11.

7963-KAJ1167456-1-P-0-b1

 Фрактальная 2225558P884448P5P-спираль. Период 17.

7974-KAJ1167467-1-P-0-b1

 Период 21.

8142-KAJ1167635-1-P-0-b1

 Период 30.

8157-KAJ1167650-1-P-0-b1

 Период 30.

8160-KAJ1167653-1-P-0-b1

 Фрактальная 11111785777P8-спираль. Период 13.

8161-KAJ1167654-1-P-0-b1

 Фрактальная 11164118-спираль. Период 8.

8168-KAJ1167661-1-P-0-b1

 Фрактальная 141174447P55P585P7577-спираль. Период 21.

8205-KAJ1167698-1-P-0-b1

 Фрактальная 22225557557557857574114441P757-спираль. Период 30.

8219-KAJ1167712-1-P-0-b1

 Фрактальная 141174447P55P585P7577-спираль. Период 21.

8221-KAJ1167714-1-P-0-b1

 Фрактальная 1114175755P777577557-спираль. Период 20.

8240-KAJ1167733-1-P-0-b1

 Фрактальная 14118575557558-спираль. Период 14.

8271-KAJ1167764-1-P-0-b1

Фрактальная спираль с периодом 30 на основе альфа-спиральных (красный) и бета-спиральных (зеленый) участков.

8276-KAJ1167769-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль.

8279-KAJ1167772-1-P-0-b1

 Фрактальная 46164141114P875574447-спираль. Период 21.

8334-KAJ1167827-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с периодом 50.

8339-KAJ1167832-1-P-0-b1

 Фрактальная 141174447P55P585P7577-спираль. Период 21.

8340-KAJ1167833-1-P-0-b1

 Фрактальная 778775585785-спираль. Период 12.

8343-KAJ1167836-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль

8357-KAJ1167850-1-P-0-b1

Двухуровневая фрактальная 11117575757577-спираль. Период 14. На основе альфа-спиральных (красный) и Q-спиральных n*(голубой-розовый) участков.

8362-KAJ1167855-1-P-0-b1

 Фрактальная 85716411-спираль. Период 8.

8363-KAJ1167856-1-P-0-b1

 Фрактальная 11111785777P8-спираль. Период 13.

8365-KAJ1167858-1-P-0-b1

Фрактальная спираль на основе альфа- (красный), 310- (оранжевый) и бета- (зеленый) спиральных участков. Период 30.

8390-KAJ1167883-1-P-0-b1

 Фрактальная PP4447777444722-спираль. Период 15.

8391-KAJ1167884-1-P-0-b1

 Такая же фрактальная спираль с поворотами.

 

8396-KAJ1167889-1-P-0-b1

 Фрактальная 5855778787-спираль (период 10) переходит в 5855778787...-спираль. Период 29.

8401-KAJ1167894-1-P-0-b1

 Фрактальная 114418557-спираль. Период 9.

8407-KAJ1167900-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль.

8409-KAJ1167902-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль.

8420-KAJ1167913-1-P-0-b1

 Фрактальная 55588-спираль. Период 5.

8425-KAJ1167918-1-P-0-b1

 Фрактальная 144147778P7557-спираль. Период 14.

8428-KAJ1167921-1-P-0-b1

 Фрактальная 1141P8-спираль. Период 6.

8429-KAJ1167922-1-P-0-b1

Фрактальная 11111111417587411177-спираль (период 20) переходит во фрактальную 14418577P777P5777577-спираль (период 20)

8442-KAJ1167935-1-P-0-b1

 Фрактальная спираль с кратной пролиновой юстировкой. Период 31.

8444-KAJ1167937-1-P-0-b1

 Фрактальная квази-спираль. Типовой период 17.

8458-KAJ1167951-1-P-0-b1

 Фрактальная 1114117875578577-спираль, Период 16.

8474-KAJ1167967-1-P-0-b1

 Фрактальная 1114178785757-спираль. Период 13.

8478-KAJ1167971-1-P-0-b1

 Фрактальная 855787757557-спираль. Период 12.

8482-KAJ1167975-1-P-0-b1

 В нижней части схемы 2D структуры белка просматривается фрактальная P444P75558-спираль. Период 10.

8500-KAJ1167993-1-P-0-b1

 Фрактальная Q-спираль или 75-спираль Кушелева.

Любопытно, что коды фрактальных спиралей образуют в геноме островки или кластеры.

Уважаемый читатель! Может быть именно от Вас зависит дата внедрения пикотехнологии белков? Ждём менеджеров по внедрению, будущих триллиардеров!

Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru


Приглашение к сотрудничеству...



В избранное