Новый релиз Bio-Linux 8 на базе Ubuntu 14.04, по словам создателей, служит идеальной системой для научной обработки и анализа биологических данных.
Гораздо чаще встречаются специализированные дистрибутивы GNU/Linux, решающие какую-то техническую задачу: обеспечивающие анонимность, позволяющие провести аудит безопасности, разного рода шлюзы, компактные версии с набором утилит. Или решающие пользовательскую задачу: игровая сборка, для работы с мультимедиа, для разворачивания HTPC и т.д. На их фоне выделяется Bio-Linux 8 — он предназначен для исследователей в области биоинформатики и предоставляет платформу для разворачивания биоинформатических рабочих станций.
Bio-Linux 8 позволяет исследователям хранить, управлять и анализировать данные в специализированном программном обеспечении. Дистрибутив построен на последней LTS-версии Ubuntu и использует графическое окружение MATE. Другие особенности дистрибутива:
обновлённые версии ключевых приложений для биоинформатики: QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-Bio и многих других;
обновление множества пакетов для языка R: ggplot2, DESeq и edgeR, а также Bioconductor и тысячи других пакетов;
заранее подготовленный шаблоны для использования в VMWare/VirtualBox;
В частности, дистрибутив поддерживает и развивает Гарвардская школа общественного здравоохранения. Более подробная информация о Bio-Linux 8 размещена на сайте, где разработчики обещают бесплатного котёнка за каждое скачивание дистрибутива.
Компания Canonical решила не уступать конкурентам* и добавила приложение для управления контейнерами Linux в своё серверное решение.
Docker полностью интегрирован в Ubuntu Server 14.04 LTS и доступен для установки с использованием команды apt-get. В качестве наглядного примера возможностей по использованию Docker в Ubuntu приведёна свободная и облачная интегрированная среда разработки Cloud 9 IDE, которая недавно обновилась. Среда Cloud 9 написана на JavaScript, использует node.js для серверной части, её исходный код доступен на GitHub. IDE поддерживает множество различных языков программирования.
Использование Docker в IDE заключается в том, что среда разработки позволяет запускать так называемые «рабочие пространства» (workspaces) в контейнерах. Разработчик может выбрать такое пространство среди предварительно настроенных, в число которых входят node.js, HTML5, Wordpress, PHP, Python, Rails, C/C++, StrongLoop, или создать своё собственное. Отдельное терминальное окно позволяет получить sudo-доступ к запущенному контейнеру и произвести ручную настройку — например, заменить установленные по умолчанию Apache и MySQL.
Компания Red Hat разработала версию операционной системы GNU/Linux, которую можно использовать для тестирования чипов и сопутствующего оборудования на базе ARMv8-A — 64-битной архитектуры ARM для серверов — с целью стандартизировать этот рынок.
Компания ARM не занимается производством процессоров, а лишь продаёт дизайн чипов производителям. Возникает ситуация, когда для работы на процессорах от разных производителей могут потребоваться разные версии ОС. Подобная участь постигла операционную систему UNIX от AT&T, которая была фрагментирована на несколько не совместимых между собой частей. Именно на решение этой проблемы нацелена компания Red Hat.
Созданный дистрибутив основывается на RHEL, но в компании его так не называют и поддержку для него не оказывают. Однако он полностью реализует спецификации ARMv8-A и нацелен на потенциальных партнёров по производству оборудования на базе ARM. В компании надеются, что стандартная реализация позволит клиентам быть уверенными в том, что их программное обеспечение будет работать на сервере ARMv8-A, приобретённом у любого производителя.
