Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

840 Шедевры белковой архитектуры. Часть 12.


Выпуск 840

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Шедевры белковой архитектуры

Часть 12.

Здесь мы видим блочную (доменную) структуру из альфа-спиральных участков (красный) и бета-спиральных участков (зеленый)

 В структуре этого белка просматривается фрактальная спираль на основе 310-спиральных участков (оранжевый)

 10 аминокислотных остатков в периоде фрактальной спирали.

14 аминокислотных остатков в периоде фрактальной спирали.

 Примерно половина этого белка - Q-спираль (спираль Кушелева, 75-спираль)

 В этом белке одна фрактальная спираль переходит в другую, третью, четвертую...

 Здесь просматриваются пи-спиральные участки (синий)

Альфа-спиральные участки (красный) и бета-спиральные участки (зелёный) образуют фрактальную спираль этого белка

 Вторая часть белка представляет собой фрактальную 85-спираль с поворотами (голубой)

 Гигантская фрактальная 7777885-спираль.

 

В этом белке фрактальные спирали сменяют друг друга многократно 

 

 

Фрактальная спираль на основе 310-спиральных участков (оранжевый). Типовой период 8 аминокислотных остатков.

 Здесь просматривается аналогичная фрактальная спираль

 Фрактальная квази спираль. Типовой период 13 аминокислотных остатков.

 Фрактальная квази спираль

 Фрактальная спираль. Период 30

 Несколько программных спиралей сменяют друг друга.

Здесь просматривается длинный участок пи-спирали (синий), длинный участок альфа-спирали (красный) и несколько разных программных (фрактальных) спиралей, содержащих пролиновые суставы (желтый)

 Многоуровневая фрактальная спираль и длинный участок бета-спирали (зелёный)

 Ряд фрактальных спиралей сменяют друг друга

 Фрактальная спираль на основе альфа-спиральных участков (красный). Период 59

 


 Фрактальная квази спираль


 Фрактальная спираль с изломами ("мерцающий фрактал")


 Фрактальная спираль с дробным периодом!

Тонкая линия показывает наклон на схеме альфа-спиральных участков. Чем сильнее наклон, тем больше период фрактальной спирали.

Эта схема фрактальной спирали с периодом 62 аминокислотных остатков. Наклон тонкой линии чуть больше, соответствует дробному периоду 62.2 


 Дискуссия с инвестором из Канады

Часть 3. 

[18:16, 16.06.2022] Александр Рудавин: Иди в баню со своим генератором. Если ты его не можешь сделать годами, то мне это не интересно

[18:18, 16.06.2022] Александр Кушелев: Без финансирования научный проект находится в замороженном состоянии

[18:18, 16.06.2022] Александр Рудавин: Пиши письмо сам. На русском языке. 

Я переведу. А Татьяна пусть пишет параллельно. И у кого лучше получится, то и запустим.

[18:19, 16.06.2022] Александр Кушелев: А что в предыдущем письме тебе не нравится? Или ты все предыдущие письма потерял?

[18:19, 16.06.2022] Александр Рудавин: Потерял

[18:22, 16.06.2022] Александр Кушелев: Вот письмо на русском языке с иллюстрациями: https://subscribe.ru/archive/science.news.nanoworldnews/201406/13212613.html

[18:22, 16.06.2022] Александр Кушелев: На сегодняшний день оно актуально. Всё, что покажется тебе лишним, можешь не переводить на английский.

[18:40, 16.06.2022] Александр Рудавин: Я просил короткое письмо. На одной страничке. Сократи!

[18:41, 16.06.2022] Александр Кушелев: Ну ладно, вот тебе письмо сегодняшнее:

Письмо-предложение для инвестора.

В лаборатории Наномир создан Emdrive в 1992-ом году. Аналогичный Emdrive испытан в NASA в 2014-ом.

В настоящее время в лаборатории Наномир изготовлен ряд Ruby Emdrive, которые после включения поднимут в 3000 раз больше своего веса на Земле.

В начале 2022 года получен режим устойчивого свечения рубинового резонатора: https://disk.yandex.ru/i/cDtwhFXBlAma8Q

В следующем эксперименте есть шанс включить рубиновый источник энергии и получить экономический эффект типа 10^17 евро за первое десятилетие.

Современная ракета сжигает тысячи тонн топлива, чтобы вывести на околоземную орбину одну тонну полезной нагрузки.

На базе Ruby Emdrive можно создать летательный аппарат, который будет иметь одинаковый вес на старте и на финише. И больше половины этого веса - полезная нагрузка.

Номинальный ряд рубиновых источников энергии обеспечит энергией всю современную технику во всех областях народного хозяйства. С кубического сантиметра установки можно получить более 10 кВт непрерывной мощности в виде электричества, тепла, света или ускорения.

[18:48, 16.06.2022] Александр Кушелев: А здесь подробности в т.ч. по другим темам: https://subscribe.ru/archive/science.news.nanoworldnews/202206/16144949.html

[19:26, 16.06.2022] Александр Рудавин: Это письмо инвестор не поймёт. Нужно простыми словами...

[19:27, 16.06.2022] Александр Кушелев: Ну так напиши, как надо. В чём проблема? Что конкретно непонятно? Могу разжевать :)

[19:30, 16.06.2022] Александр Рудавин: Все непонятно !!!

Если ты, как автор, не можешь написать письмо, то нечего с тобой и дело иметь

[19:30, 16.06.2022] Александр Кушелев: Письма инвесторам пишут менеджеры. Татьяна тебе писала. Ты одобрял, а потом терял. Ищи потерянные письма :)

[19:32, 16.06.2022] Дарья: Татьяна ещё готовит.  Передайте ему. День два и ок


 Научная "кухня" лаборатории Наномир

[16:29, 16.06.2022] Александр Кушелев: Вы несколько месяцев готовили статью, но ... в устной форме. А хочется что-то написанное увидеть. Это - не праздное любопытство. Ведь одна принципиальная ошибка может привести к тому, что статью нужно будет переписывать "с самого начала". Чтобы "снежный ком ошибок" не стал слишком велик, желательно видеть их появление в реальном времени. Если бы Виктория Соколик не показывала главу за главой и даже отдельные части каждой главы, то он до сих пор переписывала бы книгу, а Вы до сих пор не смогли бы её прочитать.

Представьте, что Вы напишите в статье, что три точки второго аминокислотного остатка можно присоединить к трём точкам первого пятью разными способами. Если этот вопрос не обсудить, то будет лишняя посылка статьи на рецензию...

Казалось бы простой вопрос, но ... принципиальный :)

[16:43, 16.06.2022] Дарья: Никогда в жизни. Я так не напишу

[17:00, 16.06.2022] Александр Кушелев: Валентин, а когда ты сможешь сделать экзешный файл Пикотех 2D? Ну и чтобы не резались на куски картинки. Нужна именно версия с компактным представлением. Развёрнутое не нужно

[17:00, 16.06.2022] Валентин: После 4го июля. 

[17:11, 16.06.2022] Александр Кушелев: Дарья, я Вам расскажу, как создавалась программа ggenedit.exe (гены виртуальной реальности). Я зашёл в компьютерный клуб. Там сидел Евгений Неделько (программист из 10 класса школы). А на экране компьютера крутился многогранник. Я его спросил, а что это?

-Скрин-сейвер. Я сам написал программу.

-О! А можешь вместо многогранника крутить фигуру из колец?

-Не проблема. Как задать координаты?

-Не знаю, но могу сказать, как двигать кольцо, чтобы получилась фигура. Сначала зеркально отразить, потом повернуть, потом ещё раз отразить...

-Хорошо. Отразить будет обозначаться командой s - симметричное отражение. sx - относительно плоскости, перпендикулярной оси X. Повернуть r.

А если поворот с дублированием кольца?

-Тогда R. Вот так и появился язык Genetics (гены виртуальной реальности). Через 15 минут я уже начал писать на этом языке первые модели.

-А можешь сделать так, чтобы по первой команде бралась какая-нибудь уже  сделанная модель, чтобы не повторять весь алгоритм до этого места?

-Пиши команду i (insert, вставить). И через полчаса я уже начал писать на второй версии языка. Через пару дней были готовы 200 моделей молекул, которые одна за другой крутились на экране компьютера. Кожевников использовал эту программу на презентации своей диссертации: 

 

Подробнее 

И на это ушло не 2 года, и даже не 2 месяца, а 2 дня :) А если до первой строчки программы или статьи ждать 2 года, то посчитайте, за сколько времени будет написано 5000 или  хотя бы 500 строк программы или статьи?

Это - кандидатская. А в этом году он защищает докторскую. Тоже педагогическую. Я знаю, что некоторые статьи, программы, книги переписывались десятки раз, т.е. проходили десятки редакций. А Вы, как я понял, собираетесь написать окончательную версию с первой попытки? Интересно, в диссертации Вы ничего не исправляли? Прямо сели через год и за день всю целиком написали? :)

[17:34, 16.06.2022] Рясина Т: Она профессионал. Ждите в спокойствии. 

[17:57, 16.06.2022] Александр Кушелев: А при чём тут профи или не профи? Профи тем более решают сложную проблему по частям. Виктория, например, присылала мне смотреть каждый этап написания книги. И то несколько принципиальных ошибок мне удалось заметить лишь в процессе дискуссии уже после публикации книги. Я даже не мог себе представить, что Виктория путает ось вращения тРНК и ось вращения белковой спирали. Но это математика, поэтому биологу такая ошибка простительна.

[17:58, 16.06.2022] Дарья: А я и математик тоже. 

[17:58, 16.06.2022] Александр Кушелев: И в научной статье могут быть разные, в т.ч. принципиальные ошибки. Причём не обязательно в области структурной биологии и математики. Например, по физике. Дарья, конечно, профи, но ... не физик

[17:58, 16.06.2022] Дарья: Физик тоже

[17:59, 16.06.2022] Александр Кушелев: Ну вот. А я об этом узнаю только через два года после нашего знакомства...

[17:59, 16.06.2022] Дарья: У меня дисер мог быть и по специальности физико-математических наук!  Все зависело какой учёный совет

[18:00, 16.06.2022] Александр Кушелев: Кстати,  есть анекдот в тему.

Профессор: Ну ладно, студент, скажите, как устроен электрон?

-Чесслово знал, но забыл.

-Жаль. Единственный человек на Земле знал, да и тот забыл...

[18:00, 16.06.2022] Дарья: )

[18:01, 16.06.2022] Александр Кушелев: Вы раньше говорили, что Ваша специальность - структурная биология

[18:00, 16.06.2022] Дарья: У меня дисер на стыке. Математика программирование физика химия биохимия биология

[18:01, 16.06.2022] Александр Кушелев: Потом добавилась ещё и математика. А теперь и физика :)

[18:00, 16.06.2022] Дарья: Приятно познакомиться!

[18:02, 16.06.2022] Александр Кушелев: Понятно. Ещё химия, биология и биохимия

[18:01, 16.06.2022] Дарья: А сейчас в структурной биологии без вот этого всего некуда

[18:03, 16.06.2022] Александр Кушелев: Меня не интересовали эти вопросы. И вот почему. Можно быть профи в математике, но класть один правильный треугольник на другой пятью разными способами :)

[18:03, 16.06.2022] Дарья: Я же не только математик )

[18:04, 16.06.2022] Александр Кушелев: Я уже давно понял

[18:04, 16.06.2022] Дарья: Вот это все и есть структурная биология

[18:05, 16.06.2022] Александр Кушелев: Понятно

Письмо-предложение для инвестора.

В лаборатории Наномир создан Emdrive в 1992-ом году. Аналогичный Emdrive испытан в NASA в 2014-ом.

В настоящее время в лаборатории Наномир изготовлен ряд Ruby Emdrive, которые после включения поднимут в 3000 раз больше своего веса на Земле...

[19:47, 16.06.2022] Александр Кушелев: Валентин, прога не может порезать этот файл на фасту: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/KAH3778307.1?report=genbank&log$=prottop&blast_rank=30&RID=APCAETCP013 


Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru



В избранное