714 Открыты многофазные периодические вторичные структуры белков!
Выпуск 714
Лаборатория Наномир
Когда реальность открывает тайны, уходят в тень и меркнут чудеса ...
Открыты многофазные периодические вторичные структуры белков!
Многофазные структуры. В данной структуре пролин (Pro) задаёт начало периода (7 аминокислотных остатков). При этом разные вторичные структуры внутри периода могут менять фазы от периода к периоду. Зачем это нужно? В частности это позволяет из прямой спирали сделать изогнутую и даже фрактальную, если фазы вторичных структур от периода к периоду будут меняться циклически.
Красные скелеты, желтые суставы и пестрые мышцы...
Красным цветом на схеме вторичной структуры белка показаны альфа-спиральные участки. Они жесткие, т.е. соответствуют костям животных. Желтым цветом показаны пролиновые суставы, которые соответствуют суставам животных. Роль мышц могут выполнять некоторые пары радикалов аминокислотных остатков. Например, лейциновые застёжки. Взаимодействующие радикалы могут принадлежать пептидным группам, входящим в состав любой вторичной структуры, поэтому "мышцы" белковых молекул на схеме вторичной структуры могут быть любого цвета, т.е. пестрыми. Как же разобраться со всеми этими функциями и их распределением в белковых молекулах? Некоторые функции просматриваются уже на уровне схемы вторичной структуры. Для других нужно строить пространственную пикотехнологическую модель, а для некоторых функций и этого будет недостаточно. Придётся проводить дополнительные исследования. Тем не менее, даже небольшое количество функций, с которыми можно разобраться на уровне правильной вторичной структуры, может дать большой экономический эффект. Ведь правильную вторичную структуру с помощью 3D генетического кода можно определить надёжно, быстро и точно.
Представьте себе, что Вы крутите фрактальный эталон. Он проходит близко от Вас, поэтому Вы его не видите. Для Вас он стал прозрачным из-за большой угловой скорости. Однако отражение этого эталона движется с малой угловой скоростью, т.к. оно далеко. В этом случае получается, что Вы можете видеть отражение невидимого! На самом деле видимое отражение невидимого бывает очень нужным, например, для водителей автотранспорта. Для этого используется целая система зеркал. А в науке видимое отражение невидимого - находка, позволяющая делать научные открытия. Но здесь исследователи пошли дальше. Например, сделали видимым остриё иглы, с которой срываются электроны:
По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.
Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"
Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.
Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.
Фрагмент модели лизоцима, замкнувшийся через дисульфидный мостик в процессе автоматической сборки по таблице композиционного генетического кода.
"Монстр" первой хромосомы человека насчитывает 5207 аминокислотных остатков.
Вторичная структура белка (фрактальная программная спираль) в компактном изображении:
Первая 1000 белковых структур за счёт лаборатории Наномир (по старой технологии это стоило бы 10 миллионов евро).
Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.
Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).
В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка.
Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.
Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.
Сотрудничество может быть различным:
- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)
- совместное создание коммерческого продукта
- поиск инвесторов
- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов
- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир
- содействие в проведении экспериментов и т.п.
- написание совместных научных статей и т.п.
- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)
Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.
