| ← Апрель 2017 → | ||||||
|
1
|
2
|
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
3
|
4
|
5
|
6
|
8
|
9
|
|
|
10
|
12
|
13
|
14
|
15
|
16
|
|
|
17
|
19
|
20
|
22
|
23
|
||
|
24
|
25
|
26
|
28
|
29
|
30
|
|
За последние 60 дней 41 выпусков (4-5 раз в неделю)
Сайт рассылки:
http://nanoworld.narod.ru
Открыта:
07-10-2005
Статистика
+1 за неделю
600 Разгадана тайна невероятной информационной ёмкости генома
|
Выпуск 600 Лаборатория Наномир Когда реальность открывает тайны, Разгадана тайна невероятной информационной ёмкости генома https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1129213514# Кушелев: Участок генома Symbiodinium microadriaticum, соответствующий бета-спирали длиной 200 аминокислотных остатков. >ENA|genom_green|
Если сдвинуть рамку считывания на 1 позицию . . . на 2 позиции . . . на 1(complement) . на 2(complement)
Сдвиг рамки считывания приводит к длинным альфа-спиралям, пи-спирали и 14-спирали. Кстати, в данном геноме эта часть последовательности используется для формирования длинной альфа-спирали EQEQEQ: https://img-fotki.yandex.ru/get/226827/ … 5_orig.png Достаточно иметь в геноме один такой участок, чтобы строить альфа-, пи- и бета-спирали длиной от 1 до 200 аминокислотных остатков. Ведь достаточно задать лишь начальное положение рамки считывания, а стоп-кодоны остановят создание спирали нужной длины. Вот где находится разгадка тайны невероятной информационной ёмкости генома!
Сдвиг рамки считывания не влияет на структуру этого белка! Белок сохраняет как первичную аминокислотную последовательность, так и вторичную структуру. Не сдвигаются даже варианты композиции относительно аминокислотной последовательности!
Структура белка, построенного по комплементарной последовательности, обладает тем же свойством! Раскрашивание триплетов по алгоритму вторичной структуры экономит время. Давайте посмотрим, как работает эта технология. Заходим на сайт поиска белка по аминокислотной последовательности: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi Набираем в окне поиска: pwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpwpw Получаем ссылку на один из найденных белков: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/45 … KRK1U3V013 Находим его нуклеотидную последовательность: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/457870492 >ENA|XP_004222167|9249 nucleotides Смотрим вторичную структуру в компактной форме:
Переходим к раскрашенным триплетам (файл triplet-html), из которого выбираем интересный фрагмент:
 Форма этой программной спирали напоминает форму сигнала в резонаторе треугольного тока 
 Вид вдоль оси симметрии *** Исследуем другой интересный фрагмент:
Вторичная структура фрагмента в развёрнутой форме:
3D модель перехода программной 31141-спирали в 33114-спираль *** Анализируем следующий интересный фрагмент:
***
Квадратная программная 33355-спираль нам уже встречалась раньше.
Фрактальные спирали белков и кварков Посмотрим ещё один интересный фрагмент:
Удлиним участок программной 22111-спирали, чтобы посмотреть, как будет выглядеть несколько витков
Это - фрактальная спираль, т.е. спираль из спирали. Аналогичную структуру имеют кварки:
Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад 50 триллионов лет назад по биологическим часам... Музыка ДНК ещё не определена, а кто-то уже продаёт "ДНК-шкатулки": https://www.youtube.com/watch?v=8PmimfEYz3g А что на самом деле представляет собой музыка ДНК/РНК? Понятно, что при сборке белковых молекул отзванивают радикалы аминокислот. Но при добавлении нуклеотидов тоже звучит музыка в том же гиперзвуковом диапазоне. Давайте попробуем рассчитать частоты собственных колебаний нуклеотидов по той же формуле Томсона, по которой в 1993-ем году мне удалось рассчитать относительные частоты аминокислотных радикалов. Формула: Частота равна обратной величине квадратного корня Здесь данные и расчет резонансных частот аминокислот: http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … 930219.htm Давайте по той же методике рассчитаем частоты для нуклеотидов ДНК/РНК ACGT - 4 нуклеотида ДНК и столько же нуклеотидов РНК. Массы нуклеотидов ДНК и РНК разные, следовательно нот может получиться 8. Но это только основных нот. Ведь в ДНК/РНК встречаются и другие нуклеотиды:
 Для начала сделаем упрощённый расчёт. Дело в том, что нуклеотиды состоят из одного атома фосфора, большого количество атомов углерода и небольшого количества атомов азота. Атом фосфора фактически является точкой стыковки нуклеода, поэтому его масса мало влияет на частоту собственных колебаний. Больше всего влияет масса азотистого основания. Именно азотистыми основаниями главным образом и отличаются нуклеотиды друг от друга. Дополнительная OH-группа в РНК понижает частоту. Интересно, на сколько? С этого момента интересно начать оценку относительных частот нуклеотидов. Для ДНК масса А складывается из 17 углеродоподобных атомов, а для РНК - из 18. 18/17=1.06 (округлённо). До 3 знака это отношение совпадает с музыкальным полутоном! А это значит, что нуклеотиды РНК "звучат" но пол тона ниже, чем нуклеотиды ДНК. Теперь давайте разберёмся с относительными частотами ACGT.
Для ДНК: 10 атомов аденина + 7 атомов дезоксирибозы = 17 Для РНК: 10 атомов аденина + 8 атомов рибозы = 18 Музыкальный ряд получается из 5 нот: 15 Эти ноты лежат на шкале частот примерно на октаву ниже, чем ноты аминокислот. Более точное взаимное отношение нот белкового и добелкового миров ещё предстоит рассчитать...  Открытие музыки ДНК / РНК привело меня к идее создания МИДИ-конвертора, создающего комплементарные ноты музыкального произведения. Complement-reverse-midi-converter Материал с форума лаборатории Наномир: Skype, [08.04.2017 13:46:12] Кушелев Александр Юрьевич: Есть идея сделать complement-reverse-midi-converter [08.04.2017 13:47:12] Кушелев Александр Юрьевич: Алгоритм очень простой. Нужно заменить ноты с номерами n на ноты с номерами 120-n [08.04.2017 13:48:06] Кушелев Александр Юрьевич: А во второй версии добавить возможность проигрывания наоборот, т.е. ноты с порядковым номером n заменить на ноты с порядковым номером N-n [08.04.2017 21:22:16] Кушелев Александр Юрьевич: http://nanoworld.org.ru/topic/1662/ Письмо Дидье Маруани / Didier Marouani от Кушелева Hello, Didier! I have new idea: Warm wishes, *** Кушелев: Пока программа Complement-reverse-midi-converter ещё не написана, я решил вручную записать комплементарные ноты для простых музыкальных произведений. Первое произведение предложил музыкант-профессионал. Оно называется "В лесу родилась ёлочка".
Комплементарные ноты, которые получены из первой фразы этого произведения. Исполняет профессионал (видео): https://cloud.mail.ru/public/6hh1/cdKKPBPgi
Копия на фейсбуке: https://www.facebook.com/10000455610133 … 252110972/
Комплементарное преобразование нот может сделать ... зеркало!  Уважаемые коллеги! Все, кто помогает создавать пикотехнологию, рубиновую энергетику, поднимает нашу цивилизацию на новую ступень развития. Всех нас можно поздравить с крупным успехом. Эксперименты в США, Германии и в Израиле подтвердили, что мы находимся на верном пути по трём главным научным направлениям лаборатории Наномир.
По теме "Рубиновая/микроволновая энергетика и транспорт" осталось сделать последний шаг, включить готовые источники энергии. Конечно, с помощью магнетрона миллиметрового диапазона создать рубиновую энергетику можно за считанные дни, но для этого нужно доделать номинальный ряд эллипсоидов и рубиновый энергетический конструктор. Спасибо за поддержку!
Что нужно лаборатории для ближайших исследований: 1. Оплатить покупку или аренду измерительной аппаратуры на диапазон от 1.78 до 53 ГГц. (От $1000). Идеальный вариант: http://www.keysight.com/en/pd-460865-pn-E8257D/psg-analog-signal-generator?&cc=RU&lc=rus 2. Начать третий этап создания средства для продления жизни: http://nanoworld.org.ru/topic/818/ Книга "Пикотехнология белков" уже в продаже!
Менеджеры, которые найдут заказы на структуры белков, получат 80% от суммы заказа! Приглашение к сотрудничеству
|
| В избранное | ||
