2006 год ознаменовал собой начало второй волны региональной экспансии в розничном секторе российского фармацевтического рынка, при этом активность проявляли не только крупные межрегиональные фармацевтические ритейлеры, но и компании традиционно сосредоточенные на деятельности в конкретном регионе страны. Продолжилась так же активная консолидация на рынке, в розничном секторе сейчас насчитывается наибольшее количество сделок по слияниям и поглощениям.
Наиболее активно себя ведёт в этом отношении компания "Аптеки 36,6", по данным рейтинга аптечных сетей ЦМИ "Фармэксперт" за 2006 год эта сеть объединяет 838 аптек. В прошедшем году компания купила 19 аптечных сетей в регионах, которые суммарно объединяют более 350 аптек.
Активно ведёт себя компания "Ригла", входящая в группу "Протек", в конце 2006 года компания приобрела небольшую сеть из восьми точек в Воронеже, а позже было объявлено о приобретении одной из крупнейших российских аптечных сетей компании "О3". Сначала согласно официальной информации сети должны были существовать в качестве параллельных бизнесов, торговая марка "О3" достаточно известна на рынке и новые владельцы видимо не хотели терять лояльных к марке клиентов. Однако несколько позже появилось сообщение о том,
что "Ригла" будет работать с "О3" на основании договора франчайзинга, все аптеки последней будут переименованы до конца 2007 года. Фактически это первый шаг объединения сетей в единую структуру. Если сети объединятся "Ригла" будет включать в себя 636 точек, суммарный оборот составит не менее 350 млн. долл.
Покупки в течение года делала так же "Имплозия", а в начале 2007 года на рынке слияний и поглощений напомнила о себе компании "Доктор Столетов", которая выкупила одну из крупнейших региональных аптечных сетей "Эфедра".
Консолидация на рынке продолжается в связи с растущей конкуренцией и возможным появлением на рынке иностранных инвесторов. Пока на рынке аптечной розницы возможен интенсивный рост и владельцы пользуются возможностью увеличить свою рыночную долю.