Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Система автоматизированной обрботки и диагностики маммограмм

СИСТЕМА АВТОМАТИЗИРОВАННОЙ ОБРАБОТКИ
И ДИАГНОСТИКИ МАММОГРАММ.

В настоящее время взгляды многих исследователей обращены к проблеме авто-матического
анализа формы объектов, информация о которых представлена в виде изо-бражений.
Частным случаем являются полутоновые изображения. Так в настоящее время в медицине
поднимается вопрос автоматического определения патологических объектов на маммограммах.
Исходными данными для обработки являются пленочные изображения маммо-грамм. На
данном изображении можно выделить следующие области:
? Область вне снимка;
? Неинформативная часть снимка;
? Грудное поле;
? Объекты интереса (в дальнейшем ОИ);
? Артефакты - технические объекты.
Для обработки маммограммы, требуется представить исходные данные в цифро-вом
виде. С этой целью разработаны две установки: на базе сканера [3] и на базе циф-рового
фотоаппарата. В обеих установках используется внешний источник света для просвечивания
снимков. При сравнении результатов оцифровки выявлено, что изобра-жения, полученные
с помощью цифрового фотоаппарата, обладают лучшими статисти-ческими характеристиками.
Для улучшения статистических характеристик отсканиро-ванного изображения разработана
процедура <<восстановления>> снимков. Данная процедура основана на преобразовании
изображения с помощью корректирующей функции и позволяет устранить амплитудные
искажения. Дальнейшая обработка изо-бражения заключается в поиске объектов ОИ
(раковые опухоли, киста и т.д.) послеNOдовательным исключением <<неинтересных>>
для нас областей.
Поиск границы снимка осуществляется на основе резNOкого перепада яркости. Для
определения границы грудного поля используется метод контрастирования изображе-ния
с гамма-коррекцией. При контрастировании диапазон яркостей изображения пре-образуется
таким образом, чтобы исключить темные участки неинформативной облас-ти. Для этого
определяются по гистограмме изображения яркости, которые относятся к темным участкам
изображения снимка. Таким образом определяется нижний предел fmin для контрастирования.
Неинформативная область снимка (пиксели с низкой ярко-стью) затемненяется путем
<<вынесения>> ее за границы палитры при присвоении значе-нию fmin нижнего предела.
В результате контрастирования явно выделяется перепад между грудным полем и неинформативной
частью снимка. Граница грудного поля сглаживается медианным фильтром, а значению
яркости неинформативной области снимка присваивается нулевое значение (<<заливка
черным>>).
Поиск объектов заключается в определении областей интереса (область, которая
полностью содержит в себе объект интереса) и выделении в ней ОИ.
Зачастую на ранней стадии заболевания врачу-рентгеннологу сложно обнаруNOжить
на маммограмме очаги распространения опухоли. Это обусловлено однотонноNOстью
получаемого изображения, а также наличием большого числа молокотоков. Т.е. основной
задачей в данном случае является подчеркивание малозаметных ОИ. Для реNOшения
этой задачи мощным инструментом является вейвлет-преобразование [1].
Вейвлетами являются функции, имеющие вид коротких волновых пакетов с ну-левым
интегральным значением и с той или иной сложной формой, локализованные по оси
независимой переменной и способные к сдвигу по ней и масштабированию [2].
Вейвлетные методы используются для распознавания и обнаружения ключеNOвых диагностических
признаков, а также для сжатия изображений с минимальными потеNOрями диагностической
информации.
Выделение очага заболевания на маммограмме с помощью вейвлетов осущестNOвляется
в несколько этапов. Первым шагом цифровое изображение маммограммы подNOвергается
двумерному дискретному вейвлет-преобразованию, в результате чего полу-чаются
коэффициенты апNOпроксимации и детализирующие коэффициенты (вертикальная, горизонтальная
и диаNOгональная составляющие).
Одним из важных свойств вейвлет-преобразования является возможность обра-ботки
коэффициентов разложения и их последующая реконструкция. Возможно при-менение
различных законов при обработке полученных коэффициентов аппроксимации и детализации.
Так в разработанном методе используется метод умножения детализи-рующих коэффициентов
на константу. Если эта константа принадлежит диапазону от 0 до 1, то влияние
детализирующих коэффициентов понижается и результирующее изо-бражение теряет
резкость. Для подчеркивания высокочастотной составляющей изобра-жения, которая
в нашем случае несет информацию о границах объектов, требуется ум-ножить детализирующие
коэффициенты на константу превышающую по значению 1. При выборе значения константы
необходимо руководствоваться исходными данными. В нашем случае исходным (обрабатываемым)
изображением является снимок маммо-граммы. Основная специфика данного изображения
заключается в том, что на нем при-сутствует большое количество мелких, в большей
части хаотически расположенных, объектов (молокотоки, кровотоки и т.п.). Данные
типы объектов в большей степени проявляются в диагональной составляющей детализирующих
коэффициентов. Искомые объекты патологий отображаются на снимке в виде пятен.
Границы объектов патологий можно подчеркнуть с помощью горизонтальной и вертикальной
составляющих детали-зирующих коэффициентов.
В итоге приходим к выводу, что для выделения мелких объектов необходимо по-высить
вес горизонтальной и вертикальной составляющих, а диагональную состав-ляющую
либо подавить, либо оставить без изменений. Значение масштабирующих ко-эффициентов
для подчеркивания объектов должно лежать в пределах от 1.5 до 3. Если значение
масштабирующих коэффициентов сделать выше, то высокочастотная состав-ляющая вейвлет
разложения при восстановлении подавит коэффициенты аппроксима-ции. Это приведет
к потере четкости контура объектов, а также появляется шум на ре-зультирующем
изображении.
После обработки детализирующих коэффициентов осуществляется обратное двумерное
дискретное вейвлет-преобразование аппроксимации и детализации. На основе сопоставления
исходного изображения и результата обработки вейвлетом выде-ляются ОИ.
Разработанная процедура обработки изображения на основе вейвлет-преобразования
позволяет выделить малозаметные пятна - зарождающиеся очаги забо-леваний. Данная
возможность помогает выявить заболевания на ранней стадии.
Выделенные объекты классифицируются. Для этого вычисляются геометричеNOские характеристики:
площадь ОИ, контур, положение центра тяжести, минимальное и максимальное расстояния
от центра тяжести до границы сглаженного объекта, главные моменты сглаженного
объекта, длины максимальной и минимальной осей инерции, эксцентриситет. По геометрическим
и яркостным характеристикам осуществляется анализ ОИ по следующим признакам:
кривизна границы объекта, коэффициент яркости объекта, вытянутость объекта вдоль
его главной оси, компактность или рыхлость фор-мы объекта, близость формы объекта
к кругу.
По данным признакам объекты относятся к классам: очаг, объект распростраNOнения
болезни, артефакт (технологические объекты, царапины и т.п.). Для классифика-ции
объектов предполагается использовать метод, основанный на нейронных сетях. На
основе признаков большого числа экспериментальных объектов сеть тренируется и
в дальнейшем самостоятельно распределяет объекты по классам.
Разработка данной системы позволит на ранней стадии предупредить заболева-ние
или остановить его развитие; избавит врача рентгенолога от монотонного и утоми-тельного
просмотра всего потока маммограмм путем автоматического распределения снимков
на классы: <<норма>> и <<патология>>.

Литература:
1. Т. Ламброу, А. Линней, Р. Спеллер. Применение вейвлет-преобразования к обраNOботке
медицинских сигналов и изображений // журнал <<Компьютера>>, 2003г, No8
2. Дьяконов В.П. Вейвлеты. От теории к практике.
3. Апанасевич В.И., Невожай Д.В., Птух Е.Я., Гридина Е.С. Аппарат для сканирования
рентгеновских снимков. Материалы 4-ой Дальневосточной онкологической конференции.
Владивосток, 2002 г

Завершение пересылаемого сообщения --
Яндекс.Почта - Проверьте почту с мобильного устройства: http://mail.ya.ru

     ответов: 0   2009-01-11 12:33:27 (#808587)

Оцифровка рентгеновских снимков

В настоящее время в медицине широко стали применяться компьютерные технологию.
Частным случаем является анализ рентгеновских снимков с помощью персонального
компьютера. Для их обработки возникает необходимость в введении данных в компьютер
в виде, совместимым с программным обеспечением. Такое введение данных возможно
осуществить несколькими методами:
- сканирование рентгеновских снимков;
- использование цифровой фотокамеры;
- непосредственная передача с рентгеновского аппарата на компьютер.
Поэтому рассмотрим оставшиеся два метода. При использовании сканера снимок просвечивается
внешним источником. Схема сканирования рентгеновского снимка представлена на
рис.1.

Недостатком первого метода является наличие встроенного источника света в сканере,
что в свою очередь повышает вероятность появления бликов на отсканированном изображении.
Также требуется определенное время на проведение сканирования снимка.
В свою очередь недостатком использования фотокамеры является более высокая стоимость
и необходимость дополнительного штатива для фиксирования фотокамеры, что в свою
очередь увеличивает громоздкость конструкции.

родолжение статьи можно скачть по ссылке:
http://depositfiles.com/files/7977374

Также можно посмотреть библиотеку по различным графическим редакторам
http://stocksphoto.narod.ru/books.html

     ответов: 0   2008-09-15 16:32:08 (#775435)

Fwd: В Вашу библиотеку.

Здравствуйте уважаемые коллеги! извиняюсь, что долго не было выпусков. со временем
немного их прибавится.

Сегодня поделюсь ссылками на книги по цифровой обработке изображений, причем
по большей части книги о вейвлет-преобразованиях.

Теория и практика вейвлет-преобразования. Воробьев В.П. Грибунин В.Г. (http://depositfiles.com/files/7408014)
Вейвлеты в компьютерной графике. Стольниц Э., ДеРоуз Т., Салезин Д. (http://depositfiles.com/files/7408446)
Цифровая обработка изображений в средде Matlab. Гонсалес Р., Вудс Р., Эддинс.
С.(http://depositfiles.com/files/7408435)
Вейвлеты. От теории к практике. Дьяконов В.П. (http://depositfiles.com/files/7408331)

Желающие, присылайте сюда также свои материалы, делитесь опытом.
Всего Вам наилучшего!
С уважением, Виктор.

     ответов: 0   2008-08-22 21:12:12 (#770838)

Система обработки маммограмм

Вb настоящее время взгляды многих исследователей обращены к проблеме автоматического
анализа формы объектов, информация о которых представлена в виде изображений.
Частным случаем являются полутоновые изображения. Так в настоящее время в медицине
поднимается вопрос автоматического определения патологических объектов на маммограммах.
Исходными данными для обработки являются пленочные изображения маммограмм. На
данном изображении можно выделить следующие области:
# Область вне снимка;
# Неинформативная часть снимка;
# Грудное поле;
# Объекты интереса (в дальнейшем ОИ);
# Артефакты - технические объекты.
Для обработки маммограммы, требуется представить исходные данные в цифровом виде.
С этой целью разработаны две установки: на базе сканера [3] и на базе цифрового
фотоаппарата. В обеих установках используется внешний источник света для просвечивания
снимков. При сравнении результатов оцифровки выявлено, что изображения, полученные
с помощью цифрового фотоаппарата, обладают лучшими статистическими характеристиками.
Для улучшения статистических характеристик отсканированного изображения разработана
процедура <<восстановления>> снимков. Данная процедура основана на преобразовании
изображения с помощью корректирующей функции и позволяет устранить амплитудные
искажения. Дальнейшая обработка изображения заключается в поиске объектов ОИ
(раковые опухоли, киста и т.д.) последовательным исключением <<неинтересных>>
для нас областей.
Поиск границы снимка осуществляется на основе резкого перепада яркости. Для определения
границы грудного поля используется метод контрастирования изображения с гамма-коррекцией.
При контрастировании диапазон яркостей изображения преобразуется таким образом,
чтобы исключить темные участки неинформативной области. Для этого определяются
по гистограмме изображения яркости, которые относятся к темным участкам изображения
снимка. Таким образом определяется нижний предел fmin для контрастирования. Неинформативная
область снимка (пиксели с низкой яркостью) затемненяется путем <<вынесения>>
ее за границы палитры при присвоении значению fmin нижнего предела. В результате
контрастирования явно выделяется перепад между грудным полем и неинформативной
частью снимка. Граница грудного поля сглаживается медианным фильтром, а значению
яркости неинформативной области снимка присваивается нулевое значение (<<заливка
черным>>).
Поиск объектов заключается в определении областей интереса (область, которая
полностью содержит в себе объект интереса) и выделении в ней ОИ.
Зачастую на ранней стадии заболевания врачу-рентгеннологу сложно обнаружить на
маммограмме очаги распространения опухоли. Это обусловлено однотонностью получаемого
изображения, а также наличием большого числа молокотоков. Т.е. основной задачей
в данном случае является подчеркивание малозаметных ОИ. Для решения этой задачи
мощным инструментом является вейвлет-преобразование [1].
Вейвлетами являются функции, имеющие вид коротких волновых пакетов с нулевым
интегральным значением и с той или иной сложной формой, локализованные по оси
независимой переменной и способные к сдвигу по ней и масштабированию [2].
Вейвлетные методы используются для распознавания и обнаружения ключевых диагностических
признаков, а также для сжатия изображений с минимальными потерями диагностической
информации.
Выделение очага заболевания на маммограмме с помощью вейвлетов осуществляется
в несколько этапов. Первым шагом цифровое изображение маммограммы подвергается
двумерному дискретному вейвлет-преобразованию, в результате чего получаются коэффициенты
аппроксимации и детализирующие коэффициенты (вертикальная, горизонтальная и диагональная
составляющие).
Одним из важных свойств вейвлет-преобразования является возможность обработки
коэффициентов разложения и их последующая реконструкция. Возможно применение
различных законов при обработке полученных коэффициентов аппроксимации и детализации.
Так в разработанном методе используется метод умножения детализирующих коэффициентов
на константу. Если эта константа принадлежит диапазону от 0 до 1, то влияние
детализирующих коэффициентов понижается и результирующее изображение теряет резкость.
Для подчеркивания высокочастотной составляющей изображения, которая в нашем случае
несет информацию о границах объектов, требуется умножить детализирующие коэффициенты
на константу превышающую по значению 1. При выборе значения константы необходимо
руководствоваться исходными данными. В нашем случае исходным (обрабатываемым)
изображением является снимок маммограммы. Основная специфика данного изображения
заключается в том, что на нем присутствует большое количество мелких, в большей
части хаотически расположенных, объектов (молокотоки, кровотоки и т.п.). Данные
типы объектов в большей степени проявляются в диагональной составляющей детализирующих
коэффициентов. Искомые объекты патологий отображаются на снимке в виде пятен.
Границы объектов патологий можно подчеркнуть с помощью горизонтальной и вертикальной
составляющих детализирующих коэффициентов.
В итоге приходим к выводу, что для выделения мелких объектов необходимо повысить
вес горизонтальной и вертикальной составляющих, а диагональную составляющую либо
подавить, либо оставить без изменений. Значение масштабирующих коэффициентов
для подчеркивания объектов должно лежать в пределах от 1.5 до 3. Если значение
масштабирующих коэффициентов сделать выше, то высокочастотная составляющая вейвлет
разложения при восстановлении подавит коэффициенты аппроксимации. Это приведет
к потере четкости контура объектов, а также появляется шум на результирующем
изображении.
После обработки детализирующих коэффициентов осуществляется обратное двумерное
дискретное вейвлет-преобразование аппроксимации и детализации. На основе сопоставления
исходного изображения и результата обработки вейвлетом выделяются ОИ.
Разработанная процедура обработки изображения на основе вейвлет-преобразования
позволяет выделить малозаметные пятна - зарождающиеся очаги заболеваний. Данная
возможность помогает выявить заболевания на ранней стадии.
Выделенные объекты классифицируются. Для этого вычисляются геометрические характеристики:
площадь ОИ, контур, положение центра тяжести, минимальное и максимальное расстояния
от центра тяжести до границы сглаженного объекта, главные моменты сглаженного
объекта, длины максимальной и минимальной осей инерции, эксцентриситет. По геометрическим
и яркостным характеристикам осуществляется анализ ОИ по следующим признакам:
кривизна границы объекта, коэффициент яркости объекта, вытянутость объекта вдоль
его главной оси, компактность или рыхлость формы объекта, близость формы объекта
к кругу.
По данным признакам объекты относятся к классам: очаг, объект распространения
болезни, артефакт (технологические объекты, царапины и т.п.). Для классификации
объектов предполагается использовать метод, основанный на нейронных сетях. На
основе признаков большого числа экспериментальных объектов сеть тренируется и
в дальнейшем самостоятельно распределяет объекты по классам.
Разработка данной системы позволит на ранней стадии предупредить заболевание
или остановить его развитие; избавит врача рентгенолога от монотонного и утомительного
просмотра всего потока маммограмм путем автоматического распределения снимков
на классы: <<норма>> и <<патология>>.

Литература:
1. Т. Ламброу, А. Линней, Р. Спеллер. Применение вейвлет-преобразования к обработке
медицинских сигналов и изображений // журнал <<Компьютера>>, 2003г, No8
2. Дьяконов В.П. Вейвлеты: От теории к практике. Изд. 2. - М.: Изд-во "СОЛОН-Пресс",
2002 г.
3. Апанасевич В.И., Невожай Д.В., Птух Е.Я., Гридина Е.С. Аппарат для сканирования
рентгеновских снимков. Материалы 4-ой Дальневосточной онкологической конференции.
Владивосток, 2002 г

     ответов: 0   2008-07-01 16:17:28 (#756996)

примерный план рассылки

Одни из первых статей будут посвящены общему алгоритму обработки рентгеновских
снимков: последовательность действий: оцифровка, предобработка, контрастирование.
ждите выпусков!

     ответов: 0   2008-06-27 16:25:09 (#756268)