Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

1317 "Мокрые методы" заметили фрактальные спирали белков!


Выпуск 1317
2024-04-26

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 "Мокрые методы" заметили фрактальные спирали белков!

Уважаемый читатель! У Вас ещё есть шанс стать финальным инвестором. После публикации научной статьи и начала выполнения заказов по структурам белков новые инвесторы нам уже не понадобятся. 

Из обсуждения с телеграм-канала: https://t.me/nanoworldlab/743

Наномир-Исследования | Nanoworld Lab. Research dep., [24.04.2024 18:02]


Ещё одну фрактальную спираль удалось определить "мокрыми методами": https://www.uniprot.org/uniprotkb/A0A1Q9E695/entry

 

Это - её вторичная структура, которая была определена по таблице 3D генетического кода много лет назад 

Аминокислотная последовательность этого белка из базы данных UniProt: 

 

MRFCGGGGGGGGGGGGGRCRAFLWWWWWWWWWWWWWYPTINGVVVVVVVVVVVVVVGHSM
AGGGGGGGGGGGGGGICDRLMWWWWWWWWWWWWWFPHHLLVVVVVVVVVVVVVVALSLPRG
GGGGGGGGGGGGATILQRWWWWWWWWWWWWWFNVERHVVVVVVVVVVVVVVLREVDGGGG
GGGGGGGGGGTLAIHEWWWWWWWWWWWWWSRSLLAVVVVVVVVVVVVVVYHSLQGGGGGGG
GGGGGGGYRQRPWWWWWWWWWWWWWWWVVVLIVVVVVVVVVVVVVVLWEQHSGGGGGGG
GGGGGGSKCLAVWWWWWWWWWWWWWCSRTDHVVVVVVVVVVVVVVRDLPKCGGGGGGGGG
GGGWWWWWWWWWWWWWLAVAQPVVVVVVVVVVVVVVSPQIPRGGGGGGGGGGGGGQQLLT
LWWWWWWWWWWWWWYNSRLDVVVVVVVVVVVVVVSTSLSGGGGGGGGGGGGGGRYNIYVWW
WWWWWWWWWWWCRPAAAVVVVVVVVVVVVVVFEGNSSGGGGGGGGGGGGGGNKSYLWWWW
WWWWWWWWWFSKPKPVVVVVVVVVVVVVVTTATNSGGGGGGGGGGGGGSQNGTQWWWWWW
WWWWWWWSSMACCVVVVVVVVVVVVVVAYQSAGGGGGGGGGGGGGGRKSEWWWWWWWWW
WWWWLTSLTNVVVVVVVVVVVVVVQLPTPGGGGGGGGGGGGGGQHPSVAWWWWWWWWWWWW
WSSPHPGVVVVVVVVVVVVVVTRTPKSGGGGGGGGGGGGGNDEGSAWWWWWWWWWWWWWSD

KLLGVVVVVVVVVVVVVVISSRNRGGGGGGGGGGGGGWRTCSWWWWWWWWWWWWWWWQVLP
LVVVVVVVVVVVVVVQHLGSGGGGGGGGGGGGGGESLDGPWWWWWWWWWWWWW

 

Правда, 310-спиральные участки интерпретаторы "мокрых методов" приняли за бета-структуру, но это легко понять. Ведь бета-спираль (официальное название L-спираль) очень похожа по плотности на 310-спираль.

Что касается пи-спиральных участков (синий), то их приняли за альфа-спиральные участки (красный). Кстати, есть фрактальная спираль, которая действительно состоит из бета-спиралей и альфа-спиралей:


Подробнее

Идентификатор: OLP87597

https://www.uniprot.org/uniprotkb/A0A1Q9CXG9/entry

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/OLP87597.1

Это так называемые транс-мембранные белки, которые практически все имеют очень длинные спиральные участки. Некоторые из них уже изучены "мокрыми методами". Однако "мокрые методы" пока не различают эти две фрактальные спирали.


Подробнее об этих фрактальных спиралях: http://nanoworld88.ru/files/800-900/800.htm

Вот как работает технология:

1. Находим файл GL с интересными белками: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LSRX01000250.1

2. "Режем" его на файлы fasta, каждый из которых кодирует один белок.

3. Запускаем программу Пикотех или Binary_SS.

Примеры структур: 

 



Подробнее

 

 Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее


Подробнее



Подробнее


Подробнее

Уважаемый читатель! У Вас ещё есть шанс стать финальным инвестором. После публикации научной статьи и начала выполнения заказов по структурам белков новые инвесторы нам уже не понадобятся. 

 


Приглашение к сотрудничеству

На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.

По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.

Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"

Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.

Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур  и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.


 

 

Инвестирование научных проектов

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.


Готовые коммерческие продукты

 

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

Telegram: https://t.me/nanoworldlab

Приглашение в группу: https://t.me/nanoworld_discussion 

WhatsApp: +7 926 850-54-22

mail: kushelev20120@yandex.ru


О способах финансирования можно спросить по электронной почте и на телеграм-канале. 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку! 


В избранное