Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

677 Как устроены пролиновые петли?


Выпуск 677

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 

Как устроены пролиновые петли?

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/AQMDqVvLU7VAlQ

Развёрнуто (фрагмент): 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/C7-C7DEkztLhqg

Пролин (Pro) имеет дополнительную степень свободы изгиба, поэтому пролиновые петли могут быть динамичными активными участками белковой молекулы, похожими на такой механизм: 

https://nplus1.ru/images/2017/10/27/30513e163ee0a357373e4d00d1ed6afc.gif

Подробнее см. в теме: "Онлайн-сервис"

Обсуждение


 Сколько фрактальных уровней у программных спиралей белка?

 Изучаем экзотические структуры белков... 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/qmwz7gqQh-EFGw

Фрактальная программная спираль состоит из участков 310-спирали (по 4 и по 3 аминокислотных остатка) 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/SEfSe6Ytet2inw

Развернуто (фрагмент): 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/X0Xco6pGTlyzRA

Фрактальная программная спираль состоит из чередующихся участков 310- и бета-спиралей. Пролин (Pro) позволяет подстраивать пролиновые углы, что обеспечивает межвитковое взаимодействие в программной спирали. При этом сама спираль может быть гибкой.

 

Развёрнуто (фрагмент): 

 

Эту фрактальную программную спираль можно смоделировать уже сегодня, т.к. она не содержит ни Pro, ни Met. Она состоит из целых витков пи-спирали и межвитковых 5775855-петель. 

 

Фрактальная программная спираль состоит из одинаковых участков альфа-спирали, согнутых на Met и петель с парами Pro, позволяющими подстраивать пролиновые углы, что обеспечивает межвитковое взаимодействие в программной спирали. 

 

Развёрнуто (фрагмент):  

 

Согласитесь, очень наглядная демонстрация композиционного (3D) генетического кода. Одинаковые остатки аспарагиновой кислоты (Asp) образуют сначала прямой участок пи-спирали (синий), затем прямой участок альфа-спирали (красный), затем прямой участок программной Q-спирали (75-спирали Кушелева). В пространстве это может быть пи-спиралью, которая переходит в двухслойную спираль. Первым слоем является альфа-спираль, а вторым - программная 75-спираль. Это предположение интересно проверить с помощью 3D-версии программы Пикотех.

Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY Part 2

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/MM_OILgWWMraUA

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/F0wzLWwHVsAvNA

Развернуто (фрагмент):

 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/dUuQc34Tm8bNSA
Обратите внимание, что прямая пи-спираль состоит из повторяющейся последовательности аминокислотных остатков.

 

 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/EK29igg9qVTAiQ
Вполне приличная музыка сборки пи-спирали (10 нот в периоде). Возможно, что эта пи-спираль является гиперзвуковым музыкальным конвейером по сборки каких-нибудь полезных молекул... 

 

 Обсуждение


 Фрактальные эталоны из ... часовых камней!

 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/zODhE71P_vJpGQ
Цитата: Часовой камень сверлится лазером, но лазерное сверление очень грубое, часовые рубины надеваются на проволоку, намазанную алмазной абразивной пастой для полировки отверстий. Мировым лидером в этой области является компания Comadur, дочерняя компания Swatch Group. Конец цитаты.

Кушелев: Таким образом, можно уже сегодня собирать корундовые фрактальные эталоны длины и угловых величин из изделий массового производства. Часовые камни "немного" дороже бисера, зато собранные из них фрактальные эталоны могут дать ядерную точность smile

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/DYpZyBsWgyUTgg

Обсуждение


Гипер-монстр белкового мира

Этот гигантский белок содержит высокий процент программных спиралей. Некоторые из них скорее всего многослойные. 

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/2jkXlNUWPvys8w

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/aRaQlynB95Bl3Q

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/Ozl7NCSiFx74TA

https://getfile.dokpub.com/yandex/get/https://yadi.sk/i/iN8KyRINsMlJVg

Интересно было бы построить пространственную модель этого белка, например, с помощью скрипта Кушелева. Но для этого скрипт придётся адаптировать к гигантскому размеру белка, т.е. уменьшить число граней фигуры, изображающей аминокислотный остаток. 

Подробнее: http://nanoworld.org.ru/topic/2145/

  Обсуждение



Инвестирование научных проектов

 

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.

 



Готовые коммерческие продукты

 

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703  +7-903-2003424 +7-916-8265031,  mail: kushelev20120@yandex.ru

Подпишитесь на мой канал на ютубе: https://www.youtube.com/channel/UCsx422KjIzwTWTBPPpwBlXQ?view_as=subscriber 

форумfacebook

веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Другие способы перевода 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку! 


В избранное