Выпуск 287

 Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 Стандарт GENETICS - альтернатива стандарту PDB

http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … enetic.htm

Цитата:

ЯЗЫК GENETICS

В каталоге GENS содержатся гены виртуальной реальности.

01 ... 108 - электронные структуры атомов по порядковым номерам.
01n... 32n - нуклонные структуры атомов по порядковым номерам.
H3PO4 - электронная поверхность молекулы фосфорной кислоты.
ACID - электронная структура аминокислоты Gly.
ALMAZ - электронная структура кристалла алмаза.
GERON - структура цепочки Герона Александрийского.
NANO - планкионная структура наномира.
PIKO - вихронная структура пикомира.
PLAST - электронная структура одноатомного слоя кристалла.
RESON18 - форма диэлектрического генератора.
VIZANROT - формы проводящих генераторов византийского стиля.

Список команд, составляющих гены:

F - фиксировать, т.е. проявить невидимое кольцо
сn - задать цвет группы под номером n.
g n [m] - группировать с n по m от конца списка элементов.
sx - симметрия по оси x от начала координат.
mx p - параллельный перенос по оси x на расстояние p.
rx p - поворот вокруг оси x на угол p градусов.
p p - масштабировать группу как единое целое в p раз.

Конец цитаты.

Первые браузеры, которые могут открывать файлы в стандарте GENETICS были созданы в 1993-ем году:

http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … readme.htm

Первая библиотека объектов в стандарте GENETICS была создана в 1993-ем году:http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … netics.zip

Типовой файл в стандарте GENETICS:

ia
ip
ry45
rx54.33
p.77
my-1.4
g1
c0

По этому файлу браузер воспроизводит 3D модель аминокислоты аланина Ala:

Напомню, что в старом стандарте PDB можно задать только центры атомов, которые стандартный браузер соединяет палочками (часто с ошибками...). При этом файл аланина будет выглядеть приблизительно так:

ATOM     50  N   ALA A   8      -7.629   8.248  15.994  1.00 27.90           N  
ATOM     51  CA  ALA A   8      -7.831   8.117  17.436  1.00 29.42           C  
ATOM     52  C   ALA A   8      -9.103   7.326  17.713  1.00 30.29           C  
ATOM     53  O   ALA A   8      -9.117   6.407  18.537  1.00 32.71           O  
ATOM     54  CB  ALA A   8      -7.926   9.489  18.083  1.00 29.86           C

Если же задать координаты всех электронов в новом стандарте PDB-PIKO, то получится приблизительно такая картина:

ATOM      1  N   ALA A   1       1.997   1.595  -0.678  1.00  0.50      A 
ATOM      2  CA  ALA A   1       2.041   0.787  -0.138  1.00  0.50      A   
ATOM      3  C   ALA A   1       1.391   0.625   0.625  1.00  0.50      A   
ATOM      4  O   ALA A   1       1.323   0.608   1.312  1.00  0.50      A   
ATOM      5  CB  ALA A   1       2.632   0.934   0.612  1.00  0.50      A
E 0000001 001 O S CA  ALA A 0.248640E01   0.898200E00 -0.300600E00  1.00 38.49           N 
E 0000002 002 O S CA  ALA A 0.187160E01   0.115420E01  0.132400E00  1.00 38.49           N
E 0000003 003 O S CA  ALA A 0.206380E01    0.383500E00    0.132400E00  1.00 38.49           N
E 0000004 004 O S CA  ALA A 0.221150E01    0.420300E00    -0.408400E00  1.00 38.49           N
E 0000004 004 O S CA  ALA A 0.174460E01    0.713300E00    -0.516100E00  1.00 38.49           N
E 0000005 001 O S C   ALA A 0.504500E00    0.404100E00    -0.515200E00  1.00 38.49           N
E 0000006 002 O N C   ALA A 0.540200E00    0.412900E00    0.045300E00  1.00 38.49           N
E 0000007 003 O S C   ALA A 0.102070E01    0.123400E00    0.019400E00  1.00 38.49           N
E 0000008 004 O N C   ALA A 0.828500E00    0.894200E00    0.019400E00  1.00 38.49           N
E 0000009 001 O S O   ALA A 0.985300E00    0.114600E00    -0.541200E00  1.00 38.49           N
E 0000010 002 O N O   ALA A 0.793100E00    0.885300E00    -0.541200E00  1.00 38.49           N
E 0000011 003 O S O   ALA A 0.127360E01    0.595800E00    -0.567200E00  1.00 38.49           N
E 0000012 004 O N O   ALA A 0.102290E01    0.942600E00    0.596700E00  1.00 38.49           N
E 0000013 005 O S O   ALA A  0.121510E01    0.171900E00    0.596700E00  1.00 38.49           N
E 0000014 006 O N O   ALA A  0.156500E01    0.107780E01    0.655400E00  1.00 38.49           N
E 0000015 001 O S  N  ALA A 0.175720E01    0.307100E00    0.655400E00  1.00 38.49           N
E 0000016 002 O N  N  ALA A 0.100880E01    0.529800E00    0.167800E01  1.00 38.49           N
E 0000017 003 O S  N  ALA A 0.155090E01    0.665000E00    0.173650E01  1.00 38.49           N
E 0000018 004 O N  N  ALA A 0.168720E01    0.289600E00    0.134160E01  1.00 38.49           N
E 0000019 005 O S  N  ALA A 0.149500E01    0.106030E01    0.134160E01  1.00 38.49           N
E 0000020 006 O N  N  ALA A 0.114510E01    0.154500E00    0.128290E01  1.00 38.49           N
E 0000021 007 O S  N  ALA A  0.952900E00    0.925200E00    0.128290E01  1.00 38.49           N
E 0000022 001 O N CB ALA A  0.245720E01    0.481300E00    0.631700E00  1.00 38.49           N
E 0000023 002 O S CB ALA A  0.238340E01    0.872500E00    0.102850E01  1.00 38.49           N
E 0000024 003 O N CB ALA A  0.292840E01    0.100840E01    0.995800E00  1.00 38.49           N
E 0000025 004 O S CB ALA A  0.300210E01    0.617200E00    0.599000E00  1.00 38.49           N
E 0000026 005 O N CB ALA A  0.226510E01    0.125280E01    0.631900E00  1.00 38.49           N
E 0000027 006 O S CB ALA A  0.280960E01    0.138860E01    0.599200E00  1.00 38.49           N
E 0000028 007 O N CB ALA A  0.288330E01    0.997000E00    0.2021 00E00  1.00 38.49           N

Согласитесь, что эта запись:

ia
ip
ry45
rx54.33
p.77
my-1.4
g1
c0

гораздо компактнее. При этом может быть задана более высокая точность положения электронов и атомных ядер.

Пикотехнология белков, ДНК, РНК

В этой строке скрипта Дениса Савина задаются параметры модели электрона:

local tObj = torus smooth:2 radius1:0.0001 radius2:0.00005 segs:fSegs sides:fSides position:[0,0,0] prefix:"tempCRO_eRing_" wirecolor:c1

Задав очень малые радиусы и выведя файл ASE мне удалось получить координаты центров электронов аланина для демонстрации примера записи в новом стандарте PDB-PIKO

 Обсуждение.

 Создание средства для  продления жизни

[19.03.2012 21:33:15] ***** хотя да, согласен, не проблема 

Обсуждение.

 Каменные шары есть не только в Коста-Рике, но и в России!

http://photofthawild.livejournal.com/61138.html

 Чампа (Архипелаг Земля Франца-Иосифа)

Кушелев: А до земли Франца-Иосифа добраться проще, чем до Коста-Рики. Интересно было бы измерить добротность этого диэлектрического резонатора "шепчущей галереи" метрового диапазона.

 Обсуждение.

 Конкурс CASP10 помогает делать научные открытия...

Конкурсный белок R00015

 Если посмотреть поближе, то ...

 можно увидеть дисульфидный мостик.

Пикотехнологическая модель фрагмента R00015 поможет дополнительно выбрать положения радикалов. Если изменить положение радикала, то дисульфидный мостик может не замкнуться...

Циклический фрагмент белка R00015, который замкнут через дисульфидный мостик Cys206-Cys253

В данном случае если переставить радикалы цистеинов, дисульфидный мостик может сохраниться 

 Обсуждение. 

 Открыты ангстремные трубки в молекулах белка...

 Здесь видна цилиндрическая полость в структуре белка. Очень любопытная деталь... 

Обсуждение. 

 Зачем заменять кольцегранные модели многогранными?

 Victoria пишет:

Кушелев: Это зависит от того, сколько у Вас аминокислотных остатков на виток получилось. Если 3, как в данном случае:

то с геометрией Евклида всё в порядке, а если бы получилось 3.6, тогда пришлось бы срочно спасать геометрию Евклида! 

 В моей упрощённой модели на грани вообще не нужно обращать внимания. Это всего лишь "кожух", видимость, бутафория...

  

 Обсуждение.

 Настраиваем транспозиционные углы...

Достаточно изменить транспозиционный угол всего на 3 градуса, и модель молекулы коллагена превращается из П-образной в вытянутую...

Модель построена по скрипту Кушелева:

a = #(); b = #()
newmat = multimaterial name:"MyMultiMat" numsubs: (12)
newmat[1].diffuse = (color 0 0 250); newmat[2].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[3].diffuse = (color 100 100 100); newmat[4].diffuse = (color 250 0 0); newmat[5].diffuse = (color 0 0 250)
N1 = box length:0.03 width:0.03 height:0.03 pos:[0,0,-0.826] wirecolor:[0,200,255]; Converttomesh N1
p = #(1.364,0.954,-3.04,0,0,255,0,1.41,-2.24,100,100,100,0,1.7,-0.539,100,100,100,0,2.53,0.293,255,0,0)
for j in 1 to 24 by 6 do(a[j] = box length:0.7 width:0.7 height:0.7 pos:[p[j],p[j+1],p[j+2]] wirecolor:[p[j+3],p[j+4],p[j+5]]; Converttomesh a[j]
a[j].material = newmat[1+j/6]; attach N1 a[j])
angz=#(97,265,25,135,147); angx=#(-3.0,-3.0,-3.0,-3.0)
kk=#(3,3,1,3,3,1,1,1,1,2,1,1,1,3,3,1,1,3,3,3,3,2,3,1,3,3,1,3,1,3
    ,3,1,1,3,1,1,3,3,1,3,1,1,3,1,3,3,1,4,1,3,1,1,1,3,3,3,1,3,1,1,3
    ,1,1,1,1,1,3,3,3,1,3,3,2,3,1,3,1,1,1,1,3,3,1,1,1,1,1,3,1,3,3,3
    ,3,3,3,3,3,1,3,3,3,1,1,1,3,1,1,1,3,3,1,2,1,3,1,1,1,1,1,3,1,1,1
    ,3,1,1,1,2,1,3,3,1,1,3,3,3,3,3,3,1,1,3,3,1,3,1,1,3,2,1,3,3,3,3
    ,1,1,3,1,1,1,3,1,3,1,3,4,4,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,3,3,1,1,1
    ,3,3,1,1,1,3,1,1,1,4,3,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,3,3,4,1,3,1
    ,1,4,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,4,1,1,1,1,1,4,1,4,1,1,1,4,1,1,1
    ,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,1,4,1,1,1,1,4,1,4,1,1,1,1,1,1,1
    ,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,3,1,4,1,1
    ,1,1,4,3,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,1
    ,1,1,1,1,3,1,1,1,3,1,1,1,1,4,3,3,1,1,1,3,4,1,1,4,1,4,1,1,1,1,1
    ,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,1,3,4,4,1,1,2,1
    ,1,1,1,1,1,1,1,3,2,1,1,1,1,1,3,4,1,1,1,3,1,1,4,3,1,3,2,2,1,1,3
    ,2,4,3,1,1,1,4,4,1,1,4,1,4,1,1,3,1,1,3,3,1,1,3,1,3,4,1,1,3,3,1
    ,3,1,1,1,1,1,1,3,1)
peptide = copy N1 wirecolor: [250,250,250]
for k = 1 to 473 do(element = copy N1;  peptide.pivot = [0,0,0]
rotate peptide 29.7 [1,0,0]; rotate peptide 55.97[0,1,0]; move peptide [1,-2.3,1.6]; peptide.pivot = [0,0,0]; rotate peptide angx[kk[k]] [1,0,0]; rotate peptide angz[kk[k]] [0,0,1]; attach peptide element)

delete N1 

Упрощённая модель коллагена (показаны только общие атомы аминокислотных остатков). Прошёл первый этап настройки композиционных и транспозиционных углов. 

 Обсуждение.

 Обоснование изгибов спиралей белка

 Victoria пишет:

Кушелев: А чем Вас не устраивают результаты модельных экспериментов, в которых видно, что протяжённые участки спиралей погнуты в одну сторону с плавно изменяющейся кривизной?

Вы понимаете, что случайно это получиться не могло?

Замените композиционный код инсулина на случайную последовательность единиц и четвёрок. И увидите, что может получиться случайно, а что жёстко запрограммировано.

Victoria:

Вы не привели ни одного экспериментального подтверждения Вашей неслучайно кривой спирали. 

Кушелев: Мы обнаружили, что форма белка, в частности, инсулина, не является случайной. Т.е. из сотен миллиардов комбинаций композиционных углов мы видим особую комбинацию, соответствующую плавно изогнутой спирали, средняя линия которой к тому же лежит в плоскости. Очевидно, что эта форма жёстко запрограммирована. Или для Вас это не очевидно?

Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/5905/126 … 0_orig.gif
Одна из спиралей инсулина.

Вы допускаете, что подобная структура могла получиться в результате компьютерного моделирования случайно? Вы понимаете, что вероятность случайного получения такой структуры так же мала, как вероятность того, что морской камень будет иметь такую же форму?

 Обсуждение.

 Рибосома продолжает раскрывать свои тайны...

Материал с форума лаборатории Наномир: 

Кушелев: Отрезанный триплет иРНК GGC остановит вращение тРНК на угле альфа-спирали. Если же триплет информационной иРНК GGG, то этот отрезанный триплет остановит вращение тРНК на угле 310-спирали. По моей гипотезе на 4 разных триплета существует 2 разных тРНК. Давайте посмотрим на таблицу тРНК:

Из этой таблицы видно, что для глицина существует как минимум 2 разных тРНК:

Дигидроуридиловая петля 
для кодона GGC - AGUGGUA, 
для кодона GGA - AGUGGUUA

Псевдоурациловая петля 
для кодона GGC - UUCGAUU, 
для кодона GGA - UUUGAUU

Первая тРНК позволяет делать выбор между GGC и GGT, т.е. ставит аминокислоту либо под углом альфа-, либо пи-спирали.

Вторая тРНК позволяет делать выбор между GGA и GGG, т.е. ставит аминокислоту либо под углом бета-, либо 310-спирали.

Это значит, что в рибосоме есть два терминирующих азотистых основания. На одном из них прекращается вращение тРНК-1, на втором - тРНК-2.

Хотелось бы увидеть полную таблицу данных для всех триплетов таблицы генетического кода.

Я бы сделал расширенную таблицу композиционного кода:

Но для этого мне нужно иметь больше экспериментальных данных, чем содержится в Вашей таблице первичных последовательностей тРНК. Вы не могли бы привести таблицу для всех триплетов?

Victoria:

Посмотрите на треонин, валин, лейцин и др. аминокислоты, разнообразие первичных структур тРНК которых опровергает Ваши построения.

Кушелев: Давайте разберёмся.

Треонин действительно помогает уточнить мою гипотезу по поводу количества тРНК на одну аминокислоту. Это количество может превосходить одну тРНК на 2 триплета иРНК. И причин может быть несколько.

Во-первых, разность углов альфа-спирали и бета-спирали отличается от разности углов 310-спирали и пи-спирали. Поэтому на 4 варианта углов 2 тРНК не хватает. Во-вторых, могут иметь место рудименты...

Более детальные исследования покажут, как оно на самом деле, но Ваши аргументы пока не приводят к fatal error  

Victoria:

Ваша т.н. модель трансляции -- бред сивой кобылы в жару, поскольку ни одна деталь Вашей модели не находит экспериментального подтверждения.

Кушелев: 
Подробнее: http://nanoworld88.narod.ru/data/240.htm

Вы просто не оценивали вероятность случайного попадания азотистого основания инозина на продольную диэфирную связь при стыковки атникодона тРНК с кодоном иРНК. А такая оценка убеждает в том, что это попадание не случайно. Так же, как не случайно получается плавный изгиб спирали инсулина, средняя линия которой лежит в плоскости:

Всё зависит от уровня понимания. На определённом уровне человек начинает отличать случайные формы от закономерных. Как Вы считаете, может на берегу моря случайно оказаться такой формы камень?

Victoria: Где уж нам уж 

Кушелев: Не, такой ответ не подходит. Нужно либо "Да", либо "Нет", либо "Не знаю"  

Victoria:

до понимания неслучайности мультиков Ваших модельных экспериментов не доросла не только я, но вместе со мной и весь научный мир.

Кушелев: Не прибедняйтесь. Не может такого быть, чтобы Вы не могли отличить эти группы объектов:

Надеюсь, что Вы сможете отличить и эти группы объектов:

На первой иллюстрации - результат работы случайной таблицы, а ниже - результат работы таблицы композиционного генетического кода:

 

Victoria:

С такими аргументами за Вашими моделями обратятся только дилетанты.

Кушелев: По большому счёту не имеет значение, кто обратится за пикотехнологическими моделями. Как говорится, "не одна, так другая" 

Лидером РСА, ЯМР, нейтронной дифракции станет та лаборатория, которая предложит самый широкий спектр услуг своим клиентам. Конечно большинство лабораторий проигнорирует предложение лаборатории Наномир, но нам-то что?

В авангарде науки всегда единицы. Большинство топчутся в хвосте 

 

Victoria:

Для Вашей гипотезы нужны именно "аргументы и факты", которые ПОЛНОСТЬЮ ОТСУТСТВУЮТ не только в Вашем сознании, но и в природе. Поэтому Вы для себя лично и заменяете результатами "модельных экспериментов". В научном мире такие подмены НЕ ПРИЕМЛЕМЫ.

Кушелев: Вы просто не в курсе.

Цитата: "модельный эксперимент", отличающийся от обычного ("прямого") эксперимента тем, что в процесс познания включается "промежуточное звено" - модель, являющаяся одновременно и средством, и объектом экспериментального исследования, заменяющим изучаемый объект. Модельный эксперимент позволяет изучать такие объекты, прямой эксперимент над которыми затруднён, экономически невыгоден, либо вообще невозможен в силу тех или иных причин

Конец цитаты.

Кушелев: А что Вы имеете против тонкого расщепления вариантов композиции?

Вы же видите, что учёт этого расщепления на уровне альфа- и 310-спиралей даёт неслучайную форму гнутых спиралей, в частности инсулина:

А из таких участков получается неслучайная структура гексамера инсулина:

Научный мир давно научился отличать случайные формы от закономерных. Так что "присоединяйтесь, богиня, присоединяйтесь..."  

Обсуждение

 Вести c ускорителей и не только!

Письма из-за бугра... 

Письмо N 

Кушелев: Зачем Вам расчёты, если я могу предоставить Вам экспериментальные данные и даже прислать изготовленные и настроенные резонаторы. Вы сможете повторить результаты, которые мы получили в Дубне. А замена одного шарика на 4 даст возможность включить рубиновый генератор 

Что касается скин-пробоя, то я Вам уже показал скин-пробой:

Я показал Вам и режим свечения сферических резонаторов без пробоя:

Этот режим Вы сможете повторить с моей помощью.

Кушелев: Больше это сколько?

Письмо N+1

>это необходимо для патентования изобретения на Вас

Кушелев: Мне патенты не нужны. Я предпочитаю Ноу-Хау 

>для расчёта резонаторов на другие частоты

Кушелев: Если показатель преломления не меняется, то длина стоячей волны пропорциональна габариту резонатора. Достаточно одного экспериментального результата, чтобы пересчитать размер резонатора на любую частоту.

>чтобы убедить руководство пригласить Вас в наши ряды. Если вы можете предоставить включённый резонатор, то, разумеется, никакие расчёты не потребуются.

Кушелев: Я Вам не предлагал включённый генератор. Я предлагал Вам повторить наш результат в Дубне. Это Вам нужно?

>По ссылкам, которые Вы прислали я не увидел ни одной видеозаписи, только картинки в формате GIF

Кушелев: GIF-файлы получены из кадров видеозаписей. Видеозапись первого эксперимента (37 режимов) занимает целый DVD. Из самых интересных кадров сделаны GIF-файлы. Видеозапись первого эксперимента была выложена на сервер Zaryad.com, но в данный момент её убрали. Моя копия видеозаписи находится на даче. Если Вас она сильно интересует, могу привезти по случаю.

>>>Я показал Вам и режим свечения сферических резонаторов без пробоя:
> то что там изображено мы наблюдаем каждый день на компенсирующих разрядниках волновода.

Кушелев: Давайте сравним видеокадры Ваших разрядников с видеокадрами свечения резонатора. Вы не поняли, что светится материал (диэлектрик) внутри?
Чем помочь? 

>>>Что касается скин-пробоя, то я Вам уже показал скин-пробой:
> Прошу прощения, но это не скин-пробой, это разряд вокруг диэлектрика. Вы, вероятно, путаете скин-пробой со скин-эффектом, эти два термина не имеют ничего общего друг с другом, несмотря на схожесть названия.

Кушелев: Вы считаете, что на этом кадре разрад идёт не по поверхности диэлектрика на на некотором расстоянии от поверхности?

А на этих видео-кадрах Вы не видите свечение внутри диэлектрических шариков?

Чем помочь? 

>>>Кушелев: Больше это сколько?
> Зависит от предоставленного материала.

Кушелев: Я говорил о повторении Вами наших результатов в Дубне. Вас это интересует? Если да, то сколько Вы готовы за это заплатить?

> Я, разумеется, не настаиваю, если Вам не нужны деньги, то у нас на примете есть ещё один специалист, который занимается в точности такими же исследованиями, но он предоставил экспериментальные данные и в данный момент готовит математическую базу. У Вас есть шанс быть первым. Дело в том, что тут не Россия и тут действуют жёсткие законы конкуренции. Кто успел, тот и сьел.

Кушелев: Я искренне желаю этому специалисту включить новый источник энергии. Для меня это будет большая радость, т.к. я смогу полностью переключить свои усилия на создание эликсира "вечной молодости": http://nanoworld.org.ru/topic/3/page/21/ 

Письмо N+2

2012-03-22  00:28

> Ноу-хау как раз и патентуется.

Кушелев: Ну Вы, блин, даёте... Ноу-Хау означает "Знаю как, но не скажу", а патент означает "скажу" 

>>>Кушелев: Если показатель преломления не меняется, то длина стоячей волны пропорциональна габариту резонатора. Достаточно одного экспериментального результата, чтобы пересчитать размер резонатора на любую частоту.
>
> Только при плоской волне и в одной плоскости, для сферического резонатора такой закон не действует. Очень странно, что Вы не знаете об этом...

Кушелев: Такой закон действует для резонаторов любой формы. Очень странно, что Вы не знаете об этом.

>>>Кушелев: GIF-файлы получены из кадров видеозаписей. Видеозапись первого эксперимента (37 режимов) занимает целый DVD.

> Вы меня удивляете, разве вы не знаете о программах видеомонтажа и конвертерах? такие программы успешно обрабатывают видео даже на древних pentium-1. А судя по Вашему форуму у Вас компьютер мощнее этих динозавров! к тому же, конвертация в видео занимает намного меньше времени чем создания GIF. Да и DVD - это всего 8 гигабайт. Неужели в России так плохо с интернетом?

Кушелев: Не вижу оснований конвертировать исходную видеозапись эксперимента в Дубне. Она записана в нормальном формате DVD. Общая длина записи более 2 часов, качество высшее. Если Вам эта запись нужна, ждите. Выложу при подходящем стечении обстоятельств. В настоящее время мой экземпляр находится на даче. Экземпляры двух экспериментов, которые я передал руководителю проекта Zaryad.com, по неизвестной мне причине стёрты с сервера.

>>>Кушелев: Давайте сравним видеокадры Ваших разрядников с видеокадрами свечения резонатора. Вы не поняли, что светится материал (диэлектрик) внутри?
>
> Я прекрасно вижу свечение диэлекрика внутри. Это называется скин-пробой, или PowerShift. Я, к сожалению, не нашёл аналога этого термина в русском языке. смысл в том, что диэлектрик поглощает излучение и переизлучает его на другой длине волны.

Кушелев: Ну вот, наконец я слышу "свечение диэлектрика внутри". Причём тут скин (поверхность), совершенно непонятно. Но хорошо, что Вы видите то же, что и я. Свечение диэлектрика внутри. И это не пробой. Это действительно переизлучение на другой длине волны. Возбуждение в миллиметровом/сантиметровом диапазоне, а переизлучение в видимом диапазоне.

Благодаря этому явлению можно уже сегодня защитить дорогие диэлектрические резонаторы от пробоя в диэлектрике и выхода из строя резонатора. Пробой в диэлектрике испортил тысячи сапфировых резонаторов, стоимость которых доходит до миллионов долларов. 

Письмо N+3  2012-03-22 23:57

> Кушелев: Такой закон действует для резонаторов любой формы. Очень странно, что Вы не знаете об этом.
>
> возьмите сферу диаметром 100 мм и вытяните её в цилиндр диаметром 1 мм. И пустите с торца волну.

Кушелев: Если Вы измените форму резонатора, то тогда "фирма ответственности не несёт" Если же Вы будете менять размер, не меняя форму, тогда проблем нет.

>> Кушелев: Не вижу оснований конвертировать исходную видеозапись эксперимента в Дубне.
> Значит с интернетом хуже некуда.

Кушелев: Странная у Вас логика. При чём тут вообще интернет? 

>> Кушелев Возбуждение в миллиметровом/сантиметровом диапазоне
> то-есть длину волны источника вы не знаете. В лазере тоже возбуждение. И переизлучение. миллиметр от сантиметра на порядок отличается.

Кушелев: Я знаю частоты в Дубне до 4 знака. Пишу мм/см, т.к. у меня есть резонаторы и на мм, и на см.

> Скин-пробой - это не пробой снаружи вовнутрь, грубо говоря - внутри диэлектрика наведённым излучением возбуждаются ионы примесей. энергия отражается от поверхности из-за границы преломления между кристаллом и воздухом внутрь кристалла. но когда энергия становится больше некоего порога - она вылетает из кристалла. это и есть скин-пробой. Видимо, я некорректно подобрал термин.

Кушелев: Да, скин (кожа, поверхность) тут явно неуместный термин.

>> Если Вы действительно можете это повторить, то будем считать, что это - обычное явление. Специалисты из Дубны считают иначе. 
> я бы не рекомендовал им верить. шифтинг проходят на 2-м курсе института.

Кушелев: Шифтинг? Я такого термина не знаю. Специалисты по СВЧ-технике тоже. Но главное, что Вы понимаете, что происходит. Переизлучение на другой длине волны в диэлектрике. Явление это известно, но специалисты перед экспериментом говорили, что свечения не будет, т.к. поверхностный пробой (скин-пробой) наступит раньше. Для скин-пробоя (пробой воздуха вдоль поверхности диэлектрика) достаточно 10^4В/м, а для свечения ионов нужно 10^6В/м. Тем не менее в 26 режиме наблюдается именно свечение ионов в диэлектрике. Я рад, что Вы можете это повторить без моей помощи  

 Обсуждение.

 Китайский сапфир дороже ставропольского...

[6:11:03] jackgfl: The EXW ptice of 1 Grade is 5200RMB//pce  equals to 867USD/pce

[6:12:18] jackgfl: The EXW price of 2 Grade is 2900RMB/pce equals to 483USD/pce
[6:13:38] jackgfl: The EXW price of 3 Grade is  2500RMB/pce equals to 417USD/pce
[6:17:28] jackgfl: The 1 Grade  can fully meet the  requirement  of optical quality
[9:38:40] Кушелев Александр Юрьевич: [6:11] jackgfl:

<<<  867USD/pce867$ - 60mm*60mm*60mm (1 pcs) ?
[9:49:55] jackgfl: yes you are right 867USD/pce[60mm*60mm*60mm
[9:51:06] jackgfl: 867USD/pce  can fully meet the requirement of optical quality
[10:18:41] Кушелев Александр Юрьевич: ОК! Thanks!
[10:21:05] Кушелев Александр Юрьевич: But this price very big... 1 kg in Russia - 500$
[10:21:46] Кушелев Александр Юрьевич: 867$ in China -?kg
[10:23:34] Кушелев Александр Юрьевич: 0.864 kg - 867$ - in China
[10:23:46] Кушелев Александр Юрьевич: 1kg - 1000$
[10:24:03] Кушелев Александр Юрьевич: In Russia 1000$ - 2kg
[10:24:07] Кушелев Александр Юрьевич: Sorry...
[10:25:05] Кушелев Александр Юрьевич: 5 kg - 680$ - Your strange price for ??? grade ?
[14:13:49] jackgfl: 5kg 680dollar is just an attractive price is not an objective price
[14:18:26] Кушелев Александр Юрьевич: What grade saphire? (5 kg 680$)
[14:18:54] Кушелев Александр Юрьевич: Or no saphire ? 
[14:20:09] Кушелев Александр Юрьевич: In Russia 1kg hi quality saphire - 500$
[14:21:35] Кушелев Александр Юрьевич: We searched more cheaply, than in Russia
[14:22:06] Кушелев Александр Юрьевич: But in China it has appeared in 2 times more expensively
[14:22:50] Кушелев Александр Юрьевич: Interesting, what quality you sell sapphire on 680 dollars for 5 kg?
[14:23:18] Кушелев Александр Юрьевич: There can be to us for some problems it will approach?
[14:23:55] Кушелев Александр Юрьевич: Show a sapphire photo for 680 dollars of 5 kg
[14:24:44] Кушелев Александр Юрьевич: I have already understood that on a site of the prices doesn't correspond to a photo. Show a photo where the price corresponds
[14:45:33] jackgfl: The manager of this vebsite does not clearly know about the objective price of the sapphire crystal
[14:46:38] jackgfl: The manager of the website did not clearly know about the true quotation of the 5kg 680dollar
[14:47:53] jackgfl: so he pressed an attractive  but wrong price
[14:49:08] Кушелев Александр Юрьевич: In Russian it is called to mislead potential clients 
[14:49:47] Кушелев Александр Юрьевич: I thank for the exhaustive information.
[14:50:14] Кушелев Александр Юрьевич: Thank You![14:58:45] jackgfl: yes it is careless mislead 

 Обсуждение.

 Остров Пасхи нам поможет?

http://www.youtube.com/watch?v=yU0r2pLDleY

http://www.youtube.com/watch?v=yU0r2pLDleY

Возможно, что уже сегодня удастся оплатить сапфир из далёкого, но родного корода *****.

Пока мастер закупает оборудование для изготовления сферического резонатора диаметром 60mm, я начинаю готовить измерительный стенд, в состав которого войдут поликорундовые волноводы, изготовленные из ... пластиковых бутылок, заполненных абразивным порошком Al2O3. По моим расчётам понадобится 2-3 кг корундового порошка на сумму около 2000 рублей.

 Обсуждение.

Создана программа моделирования гигантских белков!

 Процесс создания: Часть 1 Часть 2 Часть 3

Пикотехнологическую модель общих атомов аминокислотных остатков можно построить по этому скрипту:

N1 = sphere radius:0.3 segs:20 pos:[0,0,-0.826] wirecolor:[0,200,255]
p = #(1.364,0.954,-3.04,0,0,255,0,1.41,-2.24,100,100,100,0,1.7,-0.539,100,100,100
,0,2.53,0.293,255,0,0)
for j in 1 to 24 by 6 do(a[j] = sphere radius:0.3 segs:20 pos:[p[j],p[j+1],p[j+2]] wirecolor:[p[j+3],p[j+4],p[j+5]])
q = #(1.92,0.585,-2.5,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,2.06,0.68,-3.44,-0.792,0.317,0.5,0,0,255
,1.59,1.48,-2.46,0.22,0.66,0.66,0,0,255,1.03,0.27,-2.66,0.42,0.8,-0.47,0,0,255
,1.73,1.57,-3.40,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.17,0.36,-3.6,0.22,0.66,0.66,0,0,255    
,0.84,1.26,-3.56,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,0,2.24,-2.24,0,1,0,100,100,100
,0,1.69,-3.02,0,0.329,-0.94,100,100,100,-0.674,1.69,-1.848,-0.81,0.2835,0.45,100,100,100
,-0.674,1.136,-2.626,0.81,0.2835,0.45,100,100,100,0,0.586,-2.24,0,1,0,100,100,100
,0.674,1.686,-1.848,0.81,0.2835,0.45,100,100,100
,0.674,2.039,-0.872,0.8,0.4,-0.4,100,100,100,-0.674,2.039,-0.872,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,0.674,1.365,-0.198,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,-0.674,1.365,-0.198,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,0.674,2.867,-0.044,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,-0.674,2.867,-0.044,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0
,0.674,2.193,0.63,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0,-0.674,2.193,0.63,0.8,0.4,-0.4,255,0,0
,0,3.344,0.433,0,1,0.2,255,0,0,0,2.669,1.107,0,0.2,1,255,0,0)
for j in 1 to 207 by 9 do(b[j] = torus radius1:0.527 radius2:0.06 segs:30 sides:12 position:
[q[j],q[j+1],q[j+2]] transform:(matrixFromNormal [q[j+3],q[j+4],q[j+5]]) wirecolor:[q[j+6],q[j+7],q[j+8]])

Кушелев: Наконец, удалось смоделировать альфа-, бета-, пи- и 310-спирали белка, меняя единственный угол.

a = #(); b = #()
newmat = multimaterial name:"MyMultiMat" numsubs: (12)
newmat[1].diffuse = (color 0 0 250)
newmat[2].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[3].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[4].diffuse = (color 250 0 0)
newmat[5].diffuse = (color 0 0 250)

N1 = sphere radius:0.03 segs:20 pos:[0,0,-0.826] wirecolor:[0,200,255]; Converttomesh N1
p = #(1.364,0.954,-3.04,0,0,255,0,1.41,-2.24,100,100,100,0,1.7,-0.539,100,100,100,0,2.53,0.293,255,0,0)
for j in 1 to 24 by 6 do(a[j] = sphere radius:0.3 segs:20 pos:[p[j],p[j+1],p[j+2]] wirecolor:[p[j+3],p[j+4],p[j+5]]; Converttomesh a[j]
a[j].material = newmat[1+j/6]; attach N1 a[j])
q = #(1.92,0.585,-2.5,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,2.06,0.68,-3.44,-0.792,0.317,0.5,0,0,255,1.59,1.48,-2.46,0.22,0.66,0.66,0,0,255
,1.03,0.27,-2.66,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.73,1.57,-3.40,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.17,0.36,-3.6,0.22,0.66,0.66,0,0,255    
,0.84,1.26,-3.56,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,0,2.24,-2.24,0,1,0,100,100,100,0,1.69,-3.02,0,0.329,-0.94,100,100,100
,-0.674,1.69,-1.848,-0.81,0.2835,0.45,100,100,100,-0.674,1.136,-2.626,0.81,0.2835,0.45,100,100,100
,0,0.586,-2.24,0,1,0,100,100,100,0.674,1.686,-1.848,0.81,0.2835,0.45,100,100,100,0.674,2.039,-0.872,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,-0.674,2.039,-0.872,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,0.674,1.365,-0.198,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,-0.674,1.365,-0.198,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,0.674,2.867,-0.044,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,-0.674,2.867,-0.044,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0.674,2.193,0.63,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0
,-0.674,2.193,0.63,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0,3.344,0.433,0,1,0.2,255,0,0,0,2.669,1.107,0,0.2,1,255,0,0)
for j in 1 to 207 by 9 do(b[j] = torus radius1:0.57 radius2:0.03 segs:30 sides:12 position:[q[j],q[j+1],q[j+2]] transform:(matrixFromNormal [q[j+3],q[j+4],q[j+5]]) wirecolor:[q[j+6],q[j+7],q[j+8]]; Converttomesh b[j]; attach N1 b[j])
angz=#(98.6,267,27,125,147)
kk=#()
peptide = copy N1
for k = 1 to 20 do(element = copy N1;  peptide.pivot = [0,0,0]
rotate peptide 29.7 [1,0,0]; rotate peptide 55.97[0,1,0]; move peptide [1,-2.3,1.6]; peptide.pivot = [0,0,0]; rotate peptide angz[kk[k]] [0,0,1]; attach peptide element)
delete N1

***
В процессе моделирования удалось определить угол ненапряжённых композиций 1(4) и 3. Теперь композиционный код будет состоять не из 4, а из 6 разных цифр. Пикотехнологическая модель пи-спирали говорит о том, что число аминокислотных остатков в ненапряжённой структуре около 6 штук на виток. Рибосома может формировать напряжённую пи-спираль с числом остатков 4.4, но ... не факт. Число остатков в пи-спирали, формируемой рибосомой нужно ещё проверить...

Пикотехнологическая модель гормона панкреатической железы свиньи (фрагмент).
("Любимый белок" профессора В.Г.Туманяна) 

Нужно учесть, что это только стебель белка и только фрагмент...

Меняя угол пи-спирали мы видим, как неправильный инсулин превращается в правильный 

Любопытно, что изменение угла альфа не привело к размыканию треугольника, состоящего из спиральных участков. На это влияет только изменение угла пи. Таким образом, модель инсулина позволяет достаточно точно настроить углы альфа и пи. Интересно, как повлияет на форму модели изменение угла 310 ?

 Обсуждение.

 Как стать лидером РСА, ЯМР, нейтронной дифракции ...

Уважаемые коллеги!
Ваш спектр услуг можно расширить добавлением пикотехнологического паспорта белковых молекул, который Вы сможете дополнительно и бесплатно(!) предложить Вашим клиентам, которых интересуют структуры белков.
Пример пикотехнологического паспорта можно посмотреть здесь:

Возможность автоматического (по программе) получения пикотехнологического паспорта белковой молекулы появилась благодаря открытию композиционного генетического кода в 1992-ом году:

Научная статья

Лидером становится тот, кто предлагает самый широкий спектр услуг. Добавив пикотехнологический паспорт белковой молекулы Вы можете стать лидером...

С уважением,
Александр Кушелев,
руководитель лаборатории Наномир
http://nanoworld.narod.ru/

 Обсуждение.

 Разговор Ученого с Блондинкой

 Обсуждение.

  Приглашение к сотрудничеству

для людей умеющих самостоятельно мыслить; не просто умных, а мудрых, которые чувствуют, где истина

+7-926-5101703,   +7-903-2003424,  +7-916-8265031, Skype: Kushelev2009, mail: kushelev2011@yandex.ru

веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Другие способы перевода