Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

ДНК-генеалогия

  Все выпуски  

ДНК-генеалогия: программное обеспечение для ДНК-генеалогии


Уважаемые читатели!

Администрация сайта и форума "Молекулярная генеалогия" вновь рада приветствовать вас! Основной темой предыдущего, октябрьского,выпуска рассылки был "Российский журнал генетической генеалогии" (The Russian Journal of Genetic Genealogy) Сегодня администрация интернет-ресурса решила посветить выпуск очень важной теме: программному обеспечению для ДНК-генеалогии.

Но сперва немного статистики: на сегодняшний день на форуме создана 1581 тема, зарегистрирован 991 пользователь.


СОДЕРЖАНИЕ ВЫПУСКА

Новости

- Y-Predictor - программа-предсказатель гаплогрупп по STR-маркерам
- УПСометр - программа для нахождения потенциальных родственников по результатам анализов ДНК
- Медиа-файлы МолГена на YouTube
- RussiaDNA Project на FamilyTreeDNA
- XVII Савёловские чтения, тема "Генетика и генеалогия"

Статьи из СМИ и других источников


Новости

Y-Predictor - программа-предсказатель гаплогрупп по STR-маркерам

Люди, сделавшие тест Y-хромосомы, сталкиваются с проблемой подробной интерпретации результатов теста. Лаборатория предоставляет набор цифр (гаплотип) и определяет принадлежность к одной из основных ветвей человечества (гаплогруппе). Первый шаг к более подробным результатам помогает сделать предиктор Y-гаплогрупп, относящий гаплотип к  более тесной группе людей, а значит открывающий больше информации о предках. Вы вводите на страничке предиктора результаты теста Y-хромосомы и получаете название той веточки на общемировом дереве, к  которой относитесь Вы и Ваши предки. На просторах интернета уже существовали  два общедоступных предиктора (Whit Athey и Jim Cullen), адаптированных под гаплотипы западноевропейцев. Теперь же появился еще один предиктор Вадима Урасина, который больше приспособлен под восточноевропейские гаплотипы и учитывает всю ту немногую информацию об азиатских и африканских гаплотипах, которая есть в настоящее время. К преимуществам этого предиктора относится возможность предсказывать сразу множество гаплотипов. Это помогает как любителям ДНК-генеалогии при анализе научных статей и результатов тестов других людей, так и ученым, популяционным генетикам, для более быстрого проведения тестов. Например, лаборатория популяционной генетики ГУ МГНЦ РАМН использует предиктор Вадима Урасина. Кстати, предиктор родился в совместной работе именно с этой лабораторией.
Внутренние принципы работы предиктора просты: построено филогенетическое дерево каждой гаплогруппы на основе тысяч гаплотипов из открытых источников и научных статей, вычислен возраст предка каждой ветки. При анализе опеределенного гаплотипа он сравнивается с каждой веточкой, вычисляется разница в гаплотипах и проверяется могли ли произойти эти мутации за то время, которое прошло с зарождения ветви. Если мутаций слишком много или слишком мало, то такая ветвь не подходит и ищется более вероятная. Хотя предиктор еще будет развиваться и развиваться, уже сейчас Вы можете самостоятельно не только узнать о своей принадлежности или не принадлежности ко многим гаплогруппам и получить эксклюзивную информацию, основанную на плодах работы экспертов, о своей принадлежности или непринадлежности к ветвям, например, гаплогруппы R1a1a, наиболее частой среди россиян.


УПСометр - программа для нахождения потенциальных родственников по результатам анализов ДНК

Активными участниками дискуссий на сайте "Молекулярная генеалогия" создана и отлажена очень важная программа УПСометр. Данный инструмент предназначен для выявления и измерения так называемых Участков Половинного Совпадения (УПС, или HIR от английского Half-Identical Region). Эти участки представляют собой фрагменты хромосом, унаследованные от общих предков. Их анализ позволяет выявить степень и направление родства. Иными словами, ответить на вопросы, как давно имели два и более протестированных человека общих предков и по какой из фамильных линий. Особо отметим, что сайт является кросс-платформенным. Т.е. работает с данными от различных лабораторий, оказывающими услуги по ДНК-тестированию: FamilyTreeDNA, 23andMe и DecodeMe. Для того, чтобы получить персональные интерпретации, достаточно отправить свои данные по адресу: HIRopractors@gmail.com.


Медиа-файлы МолГена на сайте YouTube

Участниками форума созданы короткие рекламные ролики, рассказывающие о сайте "Молекулярная генеалогия", а также об истории гаплогрупп (текст - Акпер Алиев).

"Молекулярная генеалогия"
"Молекулярная генеалогия" (МолГен) - это один из крупнейших научно-популярных ресурсов в русскоязычном интернете. Основная тематика сайта - генетическая генеалогия. Новости, статьи, полезные ссылки, справочная литература и многое другое - доступны каждому посетителю.

"Molecular Genealogy" (с титрами на английском языке).
"Molecular Genealogy" (MolGen) - one of the best and largest Russian-language resource for popular science over the Internet, main theme of the site - Genetic Genealogy. News, articles, photos, graphs, useful links, and much much more. Section for International visitors to participate and get involved.

"Твоя родословная. ДНК-генеалогия" Знание истории своих предков является неотъемлемой частью культуры любого народа, а от представлений о своём родословии зависит отношение к самому себе и другим народам.ДНК-генеалогия предлагает внести ясность в вопрос изучения родословной. Один лишь тест на гаплогруппу позволяет с известной точностью установить родство по отцовской и материнской линии конкретного человека с другими людьми.

"Твоя родословная. Гаплогруппа R1a"

"Твоя родословная. Гаплогруппа N1c"

"Твоя родословная. Гаплогруппа I2"

"Твоя родословная. Гаплогруппа J2"

"Твоя родословная. Гаплогруппа I1"

"Твоя родословная. Гаплогруппа C3"

"Твоя родословная. Гаплогруппа J1"

"Твоя родословная. Гаплогруппа R1b"

"Твоя родословная. Гаплогруппа E1b1b1"

"Твоя родословная. Гаплогруппа G2a"

 

RussiaDNA Project на FamilyTreeDNA

RussiaDNA Project на FamilyTreeDNA организован для изучения гаплотипов людей, предки которых проживали на территории бывших Древней Руси, Российской империи, Советского Союза и нынешней России. Вступив в проект, Вы получаете возможность найти Ваших генетических "кузенов" и "кузин", увидеть результаты их тестирования и сравнить со своими. Если Вам захочется познакомится с Вашими генетическими "кузенами" и "кузинами", Вы сможете написать им письмо. В проекте есть карта, на которой можно посмотреть на распространение близких Вам гаплотипов и визуально представить вектор их распространения.
Отличительной особенностью RussiaDNA Project является его поддержка специалистами по филогении форума "Молген". Ими была проведена огромная работа по выявлению субкладов в мужских гаплогруппах: E1b1b1 (Balkans, Jewish cluster), I1 (прогноз по снипам), I2a (Dulebian cluster, Carpatho-Croatian cluster), J2 (прогноз по снипам), N1c1 (Baltic, Finnish, Karelian, Neuri, NorthEurasian, WestFinnish), R1a1 (Alans-Ashkenazi, Kirgizs, Pruss, Sarmats, Varyags-Vikings, Veneds, Vyatiches, EastAnts, WestAnts). Многие ветки уже подкреплены снипами. Работа по выявлению новых и уточнению старых субкладов продолжается.

 

Статьи из СМИ и других источников

Треть однофамильцев оказались родственниками

Российские ученые нашли способ узнавать, если ли родственные корни у носителей одной фамилии. А также насколько глубоко они уходят в историю. Родню удалось узнать даже через тысячу лет.
Интерес генетиков к фамилиям не случаен: по фамилиям очень заманчиво изучать генофонды. Действительно, фамилии за немногими исключениями передаются от отца к сыну, так же как мужская половая Y-хромосома. Значит, они должны наследоваться так же, как Y-хромосома, несущая определенные гены и генетические маркеры. Понятно, что фамилии в популяционных исследованиях изучать гораздо удобнее, чем проводить генетический анализ. Ведь это «бескровные» исследования. «Чтобы использовать такой подход, у нас есть все основания, — объясняет заведующий лаборатории популяционной генетики Медико-генетического научного центра РАМН доктор биологических наук Елена Балановская. – Мы изучили в разных русских популяциях изменчивость по фамилиям и сравнили ее с изменчивостью по Y-хромосоме и обнаружили, что оба показателя очень хорошо совпадают». Ключевой вопрос, на который генетики искали ответ — какая часть однофамильцев является родственниками. Впрочем, тот же вопрос интересует и обычных людей. Встречая где-нибудь своего однофамильца, человек зачастую пытается найти с ним какие-то родственные корни. Так что проект «Однофамильцы или родственники», над которым работают Елена Балановская, Екатерина Дружинина, Олег Балановский, Светлана Фролова, Марина Кузнецова и другие сотрудники лаборатории популяционной генетики, интересен как для науки, так и для каждого из нас.

Анализ дДНК из захоронений культуры европейского раннего неолита показал их ближневосточное происхождение

В Европе переход к неолиту (8,000-4,000 ВС) от охоты и собирательства к сельскохозяйственной общине был одним из наиболее важных демографических событий после начального заселения Европы анатомически современным человеком в верхнем палеолите (40,000 BC). Тем не менее, характер и скорость этого перехода является темой научных дискуссий в области археологии, антропологии и генетики. На сегодняшний день выводы о генетических составляющих прошлого населения в основном базировались на исследованиях современного евразийского населения, исследования древней ДНК более достоверно проливают свет на генетическое прошлое Европы... Проведенные исследования показали, что население культуры линейно-ленточной керамики имеет генетическую близость с современным населением Ближнего Востока и Анатолии, которое внесло основной генетический вклад с появлением сельского хозяйства в Европе. Однако, выяснилось, что население ЛЛК имело уникальные генетические особенности в распределения частот митохондриальных гаплогрупп, что подтверждает, что основные демографические события происходили в Европе после раннего неолита.


XVII Савёловские чтения, тема "Генетика и генеалогия"
 
10-11 декабря 2010 года в Государственном Историческом музее состоятся XVII Савёловские чтения, - традиционная общероссийская генеалогическая конференция, организуемая Историко-Родословным Обществом в Москве совместно с Российской генеалогической федерацией и Российским Дворянским Собранием. 10-11 декабря 2010 года в Государственном Историческом музее состоятся XVII Савёловские чтения, - традиционная общероссийская генеалогическая конференция, организуемая Историко-Родословным Обществом в Москве совместно с Российской генеалогической федерацией и Российским Дворянским Собранием. Тема чтений этого года – «Генеалогия и генетика».  Это первый в России генеалогический форум, специально посвящённый проблемам использования данных ДНК в родословных исследованиях. Среди докладчиков заявлены как профессиональные генетики, так и модераторы (ведущие) отечественных и западных ДНК-генеалогических проектов. Желающие принять участие в чтениях (выступить с докладом или просто присутствовать) могут связаться с организаторами по e-mail. Подробности и обсуждение - на сайте Молекулярная генеалогия.


В избранное