Функции специально уполномоченного органа по управлению особо охраняемыми природными территориями в г. Москве возлагаются на Департамент природопользования и охраны окружающей среды Правительства Москвы.
Устанавливаются особо охраняемые природные территории, находящиеся в ведомственном подчинении Департамента природопользования и охраны окружающей среды Правительства Москвы и Государственного учреждения "Московское городское управление лесами".